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The protein encoded by this gene enhances transcriptional activation by ligand-bound nuclear hormone receptors. However, it does this not by direct interaction with the receptor, but by direct interaction with the nuclear hormone receptor transcriptional coactivator NRC. The encoded protein may function by altering local chromatin structure. [provided by RefSeq, Jul 2008]
ZNF335 (Zinc Finger Protein 335) is a Protein Coding gene. Diseases associated with ZNF335 include Microcephaly 10, Primary, Autosomal Recessive and Microcephaly 16, Primary, Autosomal Recessive. Among its related pathways are Activated PKN1 stimulates transcription of AR (androgen receptor) regulated genes KLK2 and KLK3 and Developmental Biology. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include transcription regulatory region DNA binding and RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding. An important paralog of this gene is ZFP64.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0000976 | transcription regulatory region sequence-specific DNA binding | ISS | -- |
GO:0000978 | RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding | IEA,IBA | 21873635 |
GO:0000981 | DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific | ISM | 19274049 |
GO:0003676 | nucleic acid binding | IEA | -- |
GO:0003677 | DNA binding | IEA | -- |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0005634 | nucleus | IBA,ISS | -- |
GO:0005654 | nucleoplasm | IDA | -- |
GO:0035097 | colocalizes_with histone methyltransferase complex | IEA,IDA | 23178126 |
SuperPathway | Contained pathways | ||
---|---|---|---|
1 | Activated PKN1 stimulates transcription of AR (androgen receptor) regulated genes KLK2 and KLK3 | ||
2 | Developmental Biology |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0001701 | in utero embryonic development | IEA | -- |
GO:0002052 | positive regulation of neuroblast proliferation | IEA,ISS | -- |
GO:0006357 | regulation of transcription by RNA polymerase II | IEA | -- |
GO:0007275 | multicellular organism development | IEA | -- |
GO:0007420 | brain development | IEA,IMP | 23178126 |
ExUns: | 1a | · | 1b | ^ | 2a | · | 2b | · | 2c | ^ | 3a | · | 3b | · | 3c | ^ | 4a | · | 4b | · | 4c | · | 4d | ^ | 5 | ^ | 6 | ^ | 7 | ^ | 8a | · | 8b | ^ | 9a | · | 9b | · | 9c | ^ | 10a | · | 10b | · | 10c | · | 10d | ^ | 11a | · | 11b | ^ |
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SP1: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ExUns: | 12a | · | 12b | ^ | 13 | ^ | 14 | ^ | 15a | · | 15b | ^ | 16a | · | 16b | · | 16c | · | 16d | ^ | 17a | · | 17b | ^ | 18a | · | 18b | ^ | 19a | · | 19b | ^ | 20 | ^ | 21a | · | 21b | · | 21c | · | 21d | ^ | 22a | · | 22b | ^ | 23 | ^ | 24 | ^ | 25 | ^ |
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SP1: | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP21: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP22: |
ExUns: | 26 | ^ | 27a | · | 27b | ^ | 28 | ^ | 29a | · | 29b |
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SP1: | |||||||||||
SP2: | |||||||||||
SP3: | |||||||||||
SP4: | |||||||||||
SP5: | |||||||||||
SP6: | |||||||||||
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SP11: | |||||||||||
SP12: | |||||||||||
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SP21: | |||||||||||
SP22: |
This gene was present in the common ancestor of chordates.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
---|---|---|---|---|---|
Chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | ZNF335 30 31 |
|
OneToOne | |
Dog (Canis familiaris) |
Mammalia | ZNF335 30 31 |
|
OneToOne | |
Cow (Bos Taurus) |
Mammalia | ZNF335 30 31 |
|
OneToOne | |
Rat (Rattus norvegicus) |
Mammalia | Zfp335 30 |
|
||
Mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Zfp335 30 17 31 |
|
OneToOne | |
Oppossum (Monodelphis domestica) |
Mammalia | ZNF335 31 |
|
OneToOne | |
Chicken (Gallus gallus) |
Aves | ZNF335 30 31 |
|
OneToOne | |
Lizard (Anolis carolinensis) |
Reptilia | -- 31 |
|
OneToMany | |
-- 31 |
|
OneToMany | |||
African clawed frog (Xenopus laevis) |
Amphibia | Xl.27543 30 |
|
||
Tropical Clawed Frog (Silurana tropicalis) |
Amphibia | Str.1147 30 |
|
||
Zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | LOC100148891 30 |
|
||
ZNF335 31 |
|
OneToOne |
SNP ID | Clinical significance and condition | Chr 20 pos | Variation | AA Info | Type |
---|---|---|---|---|---|
638420 | Uncertain Significance: Primary autosomal recessive microcephaly 10 | 45,969,658(-) | G/A | MISSENSE_VARIANT | |
709516 | Benign: not provided | 45,971,308(-) | C/A | MISSENSE_VARIANT | |
712868 | Benign: not provided | 45,952,350(-) | T/C | MISSENSE_VARIANT | |
716509 | Benign: not provided | 45,950,068(-) | A/G | SYNONYMOUS_VARIANT | |
718966 | Likely Benign: not provided | 45,969,488(-) | C/T | SYNONYMOUS_VARIANT |
Disorder | Aliases | PubMed IDs |
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microcephaly 10, primary, autosomal recessive |
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microcephaly 16, primary, autosomal recessive |
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primary autosomal recessive microcephaly |
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microcephaly 15, primary, autosomal recessive |
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microcephaly 13, primary, autosomal recessive |
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