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This gene encodes a member of the peptidase C19 or ubiquitin-specific protease family of cysteine proteases. Members of this family remove ubiquitin molecules from polyubiquitinated proteins. The encoded protein may deubiquitinate and stabilize the transcription factor c-Myc, also known as MYC, an important oncoprotein known to be upregulated in most human cancers. The encoded protease may also regulate the activation of autophagy. This gene exhibits elevated expression in some breast and lung cancers. [provided by RefSeq, Mar 2016]
USP36 (Ubiquitin Specific Peptidase 36) is a Protein Coding gene. Among its related pathways are Ubiquitin-Proteasome Dependent Proteolysis. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include thiol-dependent ubiquitin-specific protease activity. An important paralog of this gene is USP42.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0003723 | RNA binding | HDA | 22658674 |
GO:0004197 | cysteine-type endopeptidase activity | IBA | 21873635 |
GO:0004843 | thiol-dependent ubiquitin-specific protease activity | IDA | 14715245 |
GO:0005515 | protein binding | IPI | 25775507 |
GO:0008233 | peptidase activity | IEA | -- |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0005634 | nucleus | IEA | -- |
GO:0005730 | nucleolus | IDA | 19208757 |
GO:0005737 | cytoplasm | IDA,IEA | 27445338 |
GO:0016607 | nuclear speck | IDA | -- |
SuperPathway | Contained pathways | ||
---|---|---|---|
1 | Ubiquitin-Proteasome Dependent Proteolysis |
Ubiquitin-Proteasome Dependent Proteolysis
-
|
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0006508 | proteolysis | IEA | -- |
GO:0006511 | ubiquitin-dependent protein catabolic process | IEA | -- |
GO:0007000 | nucleolus organization | ISS | -- |
GO:0016242 | negative regulation of macroautophagy | IMP | 22622177 |
GO:0016578 | histone deubiquitination | IMP | 29274341 |
Name | Status | Disease Links | Group | Role | Mechanism of Action | Clinical Trials |
---|---|---|---|---|---|---|
Water | Approved | Pharma | 0 |
ExUns: | 1 | ^ | 2 | ^ | 3a | · | 3b | · | 3c | ^ | 4a | · | 4b | · | 4c | · | 4d | · | 4e | · | 4f | · | 4g | ^ | 5a | · | 5b | ^ | 6a | · | 6b | ^ | 7a | · | 7b | · | 7c | · | 7d | ^ | 8a | · | 8b | ^ | 9a | · | 9b | ^ | 10a | · | 10b | ^ |
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SP1: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP12: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP15: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP21: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP22: |
ExUns: | 11 | ^ | 12a | · | 12b | ^ | 13 | ^ | 14a | · | 14b | · | 14c | ^ | 15 | ^ | 16 | ^ | 17a | · | 17b | ^ | 18 | ^ | 19 | ^ | 20 | ^ | 21 | ^ | 22 | ^ | 23 | ^ | 24 | ^ | 25 | ^ | 26 | ^ | 27a | · | 27b | · | 27c | ^ | 28a | · | 28b | · | 28c | · |
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SP1: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP18: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP20: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP21: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP22: | - |
ExUns: | 28d | ^ | 29 | ^ | 30 | ^ | 31 |
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SP1: | |||||||
SP2: | |||||||
SP3: | |||||||
SP4: | |||||||
SP5: | |||||||
SP6: | |||||||
SP7: | |||||||
SP8: | |||||||
SP9: | |||||||
SP10: | - | ||||||
SP11: | |||||||
SP12: | |||||||
SP13: | |||||||
SP14: | |||||||
SP15: | |||||||
SP16: | |||||||
SP17: | |||||||
SP18: | - | - | - | ||||
SP19: | |||||||
SP20: | |||||||
SP21: | |||||||
SP22: |
This gene was present in the common ancestor of animals and fungi.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
---|---|---|---|---|---|
chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | USP36 33 32 |
|
OneToOne | |
dog (Canis familiaris) |
Mammalia | USP36 33 32 |
|
OneToOne | |
rat (Rattus norvegicus) |
Mammalia | Usp36 32 |
|
||
cow (Bos Taurus) |
Mammalia | USP36 33 32 |
|
OneToOne | |
mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Usp36 17 33 32 |
|
||
oppossum (Monodelphis domestica) |
Mammalia | -- 33 |
|
OneToMany | |
-- 33 |
|
OneToMany | |||
platypus (Ornithorhynchus anatinus) |
Mammalia | USP36 33 |
|
OneToOne | |
chicken (Gallus gallus) |
Aves | USP36 33 32 |
|
OneToOne | |
lizard (Anolis carolinensis) |
Reptilia | USP36 33 |
|
OneToOne | |
African clawed frog (Xenopus laevis) |
Amphibia | LOC398902 32 |
|
||
zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | usp36 33 |
|
OneToOne | |
wufd19b04 32 |
|
||||
rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) |
Actinopterygii | Omy.12981 32 |
|
||
fruit fly (Drosophila melanogaster) |
Insecta | scny 33 |
|
OneToMany | |
baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) |
Saccharomycetes | UBP8 33 |
|
OneToMany | |
fission yeast (Schizosaccharomyces pombe) |
Schizosaccharomycetes | ubp16 32 |
|
||
sea squirt (Ciona savignyi) |
Ascidiacea | Cin.2285 32 |
|
||
sea squirt (Ciona intestinalis) |
Ascidiacea | Cin.2285 32 |
|
SNP ID | Clin | Chr 17 pos | Variation | AA Info | Type |
---|---|---|---|---|---|
rs1000051845 | -- | 78,822,350(-) | A/C | intron_variant | |
rs1000068866 | -- | 78,803,000(-) | G/A | intron_variant | |
rs1000069740 | -- | 78,835,647(-) | G/A | intron_variant | |
rs1000094026 | -- | 78,789,058(-) | G/A | genic_downstream_transcript_variant, intron_variant | |
rs1000144261 | -- | 78,794,198(-) | G/A | genic_downstream_transcript_variant, intron_variant |
Variant ID | Type | Subtype | PubMed ID |
---|---|---|---|
esv3641341 | CNV | loss | 21293372 |
No disorders were found for USP36 Gene.