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SPEF2 (Sperm Flagellar 2) is a Protein Coding gene. Diseases associated with SPEF2 include Spermatogenic Failure 43 and Primary Ciliary Dyskinesia. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include protein dimerization activity.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0003674 | molecular_function | ND | -- |
GO:0005515 | protein binding | IEA | -- |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0002177 | manchette | ISS | -- |
GO:0005576 | extracellular region | IEA | -- |
GO:0005737 | cytoplasm | ISS | -- |
GO:0005794 | Golgi apparatus | ISS | -- |
GO:0097225 | sperm midpiece | ISS | -- |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0003351 | epithelial cilium movement | ISS | -- |
GO:0007283 | spermatogenesis | ISS | -- |
GO:0007288 | sperm axoneme assembly | ISS | -- |
GO:0030154 | cell differentiation | IEA | -- |
GO:0048705 | skeletal system morphogenesis | ISS | -- |
ExUns: | 1a | · | 1b | · | 1c | ^ | 2 | ^ | 3a | · | 3b | ^ | 4 | ^ | 5 | ^ | 6 | ^ | 7 | ^ | 8a | · | 8b | ^ | 9 | ^ | 10 | ^ | 11 | ^ | 12a | · | 12b | ^ | 13 | ^ | 14a | · | 14b | ^ | 15 | ^ | 16 | ^ | 17 | ^ | 18 | ^ | 19 | ^ | 20 | ^ |
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SP1: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: |
ExUns: | 21 | ^ | 22 | ^ | 23a | · | 23b | ^ | 24a | · | 24b | ^ | 25 | ^ | 26 | ^ | 27 | ^ | 28 | ^ | 29 | ^ | 30 | ^ | 31 | ^ | 32 | ^ | 33 | ^ | 34 | ^ | 35 |
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SP1: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: |
This gene was present in the common ancestor of chordates.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
---|---|---|---|---|---|
Chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | SPEF2 30 31 |
|
OneToOne | |
Dog (Canis familiaris) |
Mammalia | SPEF2 30 31 |
|
OneToOne | |
Cow (Bos Taurus) |
Mammalia | SPEF2 30 31 |
|
OneToOne | |
Rat (Rattus norvegicus) |
Mammalia | Spef2 30 |
|
||
Mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Spef2 30 17 31 |
|
OneToOne | |
Platypus (Ornithorhynchus anatinus) |
Mammalia | -- 31 |
|
OneToMany | |
-- 31 |
|
OneToMany | |||
-- 31 |
|
OneToMany | |||
-- 31 |
|
OneToMany | |||
-- 31 |
|
OneToMany | |||
Oppossum (Monodelphis domestica) |
Mammalia | SPEF2 31 |
|
OneToOne | |
Chicken (Gallus gallus) |
Aves | SPEF2 30 31 |
|
OneToOne | |
Lizard (Anolis carolinensis) |
Reptilia | SPEF2 31 |
|
OneToOne | |
Tropical Clawed Frog (Silurana tropicalis) |
Amphibia | spef2 30 |
|
||
Str.19623 30 |
|
||||
Zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | spef2 30 31 |
|
OneToOne | |
Sea Squirt (Ciona savignyi) |
Ascidiacea | -- 31 |
|
OneToOne |
SNP ID | Clinical significance and condition | Chr 05 pos | Variation | AA Info | Type |
---|---|---|---|---|---|
708818 | Benign: not provided | 35,727,832(+) | A/T | INTRON_VARIANT | |
722366 | Benign: not provided | 35,641,566(+) | A/G | SYNONYMOUS_VARIANT | |
722367 | Benign: not provided | 35,691,081(+) | T/C | SYNONYMOUS_VARIANT | |
722368 | Benign: not provided | 35,691,131(+) | C/T | MISSENSE_VARIANT | |
722369 | Benign: not provided | 35,697,779(+) | A/G | MISSENSE_VARIANT |
Disorder | Aliases | PubMed IDs |
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spermatogenic failure 43 |
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primary ciliary dyskinesia |
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non-syndromic male infertility due to sperm motility disorder |
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