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SIDT2 (SID1 Transmembrane Family Member 2) is a Protein Coding gene. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include RNA transmembrane transporter activity. An important paralog of this gene is SIDT1.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0003677 | DNA binding | IEA | -- |
GO:0003723 | RNA binding | IEA | -- |
GO:0003725 | double-stranded RNA binding | IBA | 21873635 |
GO:0035612 | AP-2 adaptor complex binding | ISS | -- |
GO:0035650 | AP-1 adaptor complex binding | ISS | -- |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0005764 | lysosome | IBA,IDA | 28277980 |
GO:0005765 | lysosomal membrane | IEA,IDA | 17897319 |
GO:0005886 | plasma membrane | IBA,IDA | 28277980 |
GO:0016020 | membrane | IEA | -- |
GO:0016021 | integral component of membrane | IEA | -- |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0000902 | cell morphogenesis | IEA | -- |
GO:0003323 | type B pancreatic cell development | IEA | -- |
GO:0006401 | RNA catabolic process | ISS | -- |
GO:0009749 | response to glucose | IEA | -- |
GO:0033227 | dsRNA transport | IEA | -- |
ExUns: | 1a | · | 1b | ^ | 2 | ^ | 3a | · | 3b | · | 3c | ^ | 4 | ^ | 5 | ^ | 6a | · | 6b | ^ | 7 | ^ | 8 | ^ | 9 | ^ | 10a | · | 10b | ^ | 11 | ^ | 12 | ^ | 13 | ^ | 14 | ^ | 15a | · | 15b | ^ | 16a | · | 16b | · | 16c | · | 16d | ^ | 17a | · |
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SP1: | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: |
ExUns: | 17b | ^ | 18a | · | 18b | ^ | 19a | · | 19b | ^ | 20a | · | 20b | ^ | 21a | · | 21b | · | 21c | ^ | 22 | ^ | 23 | ^ | 24a | · | 24b | ^ | 25 | ^ | 26a | · | 26b | ^ | 27 | ^ | 28a | · | 28b | · | 28c |
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SP1: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: |
This gene was present in the common ancestor of animals.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
---|---|---|---|---|---|
Chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | SIDT2 30 31 |
|
OneToOne | |
Cow (Bos Taurus) |
Mammalia | SIDT2 30 31 |
|
OneToOne | |
Dog (Canis familiaris) |
Mammalia | SIDT2 30 31 |
|
OneToOne | |
Mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Sidt2 30 17 31 |
|
OneToOne | |
Rat (Rattus norvegicus) |
Mammalia | Sidt2 30 |
|
||
Oppossum (Monodelphis domestica) |
Mammalia | SIDT2 31 |
|
OneToOne | |
Chicken (Gallus gallus) |
Aves | SIDT2 30 31 |
|
OneToOne | |
Lizard (Anolis carolinensis) |
Reptilia | SIDT2 31 |
|
OneToOne | |
Tropical Clawed Frog (Silurana tropicalis) |
Amphibia | sidt2 30 |
|
||
Str.18477 30 |
|
||||
African clawed frog (Xenopus laevis) |
Amphibia | Xl.14690 30 |
|
||
Zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | sidt2 31 |
|
OneToOne | |
wufc73a07 30 |
|
||||
Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss) |
Actinopterygii | Omy.6494 30 |
|
||
Worm (Caenorhabditis elegans) |
Secernentea | tag-130 30 |
|
||
chup-1 31 |
|
ManyToMany | |||
sid-1 31 |
|
ManyToMany |
SNP ID | Clinical significance and condition | Chr 11 pos | Variation | AA Info | Type |
---|---|---|---|---|---|
779316 | Benign: not provided | 117,192,273(+) | C/T | MISSENSE_VARIANT | |
779317 | Benign: not provided | 117,192,304(+) | C/T | SYNONYMOUS_VARIANT | |
789211 | Benign: not provided | 117,186,578(+) | A/G | INTRON_VARIANT | |
rs12285035 | - | p.Thr631Met | |||
rs17120425 | - | p.Val636Ile |
Variant ID | Type | Subtype | PubMed ID |
---|---|---|---|
dgv2186n54 | CNV | loss | 21841781 |
dgv730n106 | OTHER | inversion | 24896259 |
nsv1078301 | OTHER | inversion | 25765185 |
nsv518908 | CNV | loss | 19592680 |
nsv524270 | CNV | loss | 19592680 |
nsv7223 | OTHER | inversion | 18451855 |
No disorders were found for SIDT2 Gene.