Free for academic non-profit institutions. Other users need a Commercial license
The protein encoded by this gene contains a ring finger motif, which is known to be involved in protein-protein interactions. The specific function of this protein has not yet been determined. EST data suggests the existence of multiple alternatively spliced transcript variants, however, their full length nature is not known. [provided by RefSeq, Jul 2008]
RNF10 (Ring Finger Protein 10) is a Protein Coding gene. Diseases associated with RNF10 include Spastic Paraplegia 62, Autosomal Recessive and Superficial Keratitis. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include ubiquitin-protein transferase activity and transcription regulatory region DNA binding.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0000976 | transcription regulatory region sequence-specific DNA binding | ISS, IBA | -- |
GO:0003677 | DNA binding | IEA | -- |
GO:0005515 | protein binding | IPI | 16335786 |
GO:0044212 | transcription regulatory region DNA binding | ISS | -- |
GO:0046872 | metal ion binding | IEA | -- |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0005634 | nucleus | ISS | -- |
GO:0005737 | cytoplasm | IEA,IDA | 16335786 |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0010626 | negative regulation of Schwann cell proliferation | ISS | -- |
GO:0031643 | positive regulation of myelination | IBA,ISS | -- |
GO:0045893 | positive regulation of transcription, DNA-templated | IDA | 16335786 |
GO:0045944 | positive regulation of transcription by RNA polymerase II | ISS | -- |
GO:0051865 | protein autoubiquitination | IDA | 24105792 |
ExUns: | 1a | · | 1b | · | 1c | · | 1d | ^ | 2 | ^ | 3 | ^ | 4a | · | 4b | · | 4c | · | 4d | ^ | 5a | · | 5b | · | 5c | ^ | 6 | ^ | 7a | · | 7b | · | 7c | ^ | 8a | · | 8b | · | 8c | · | 8d | ^ | 9a | · | 9b | ^ | 10a | · | 10b | ^ | 11a | · |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SP1: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP14: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP15: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP16: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP17: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP18: | - | - | - | - | - | - |
ExUns: | 11b | ^ | 12a | · | 12b | · | 12c | ^ | 13a | · | 13b | ^ | 14a | · | 14b | · | 14c | ^ | 15a | · | 15b | ^ | 16 | ^ | 17 | ^ | 18 | ^ | 19a | · | 19b | ^ | 20 | ^ | 21 | ^ | 22 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SP1: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP14: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP15: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP16: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP17: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP18: |
This gene was present in the common ancestor of animals and fungi.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
---|---|---|---|---|---|
Chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | RNF10 30 31 |
|
OneToOne | |
Dog (Canis familiaris) |
Mammalia | RNF10 30 |
|
||
-- 31 |
|
OneToMany | |||
-- 31 |
|
OneToMany | |||
Cow (Bos Taurus) |
Mammalia | RNF10 30 31 |
|
OneToOne | |
Mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Rnf10 30 17 31 |
|
OneToOne | |
Rat (Rattus norvegicus) |
Mammalia | Rnf10 30 |
|
||
Platypus (Ornithorhynchus anatinus) |
Mammalia | -- 31 |
|
OneToMany | |
-- 31 |
|
OneToMany | |||
Oppossum (Monodelphis domestica) |
Mammalia | RNF10 31 |
|
OneToOne | |
Chicken (Gallus gallus) |
Aves | RNF10 30 31 |
|
OneToOne | |
Lizard (Anolis carolinensis) |
Reptilia | RNF10 31 |
|
OneToOne | |
Tropical Clawed Frog (Silurana tropicalis) |
Amphibia | rnf10 30 |
|
||
MGC75603 30 |
|
||||
African clawed frog (Xenopus laevis) |
Amphibia | Xl.22040 30 |
|
||
Zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | rnf10 30 31 |
|
OneToOne | |
Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss) |
Actinopterygii | Omy.9616 30 |
|
||
African malaria mosquito (Anopheles gambiae) |
Insecta | AgaP_AGAP007954 30 |
|
||
Fruit Fly (Drosophila melanogaster) |
Insecta | CG12099 30 31 32 |
|
OneToOne | |
Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) |
Saccharomycetes | MAG2 31 33 |
|
OneToOne | |
Sea Squirt (Ciona savignyi) |
Ascidiacea | CSA.4621 31 |
|
OneToOne |
SNP ID | Clinical significance and condition | Chr 12 pos | Variation | AA Info | Type |
---|---|---|---|---|---|
727629 | Likely Benign: not provided | 120,546,580(+) | T/C | SYNONYMOUS_VARIANT | |
784474 | Benign: not provided | 120,562,975(+) | G/A | MISSENSE_VARIANT | |
rs16950277 | - | p.Glu433Asp | |||
rs17852961 | - | p.Leu332Phe |
Variant ID | Type | Subtype | PubMed ID |
---|---|---|---|
esv2746473 | CNV | deletion | 23290073 |
esv3630927 | CNV | loss | 21293372 |
nsv906 | CNV | deletion | 18451855 |
Disorder | Aliases | PubMed IDs |
---|---|---|
spastic paraplegia 62, autosomal recessive |
|
|
superficial keratitis |
|
|