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PRMT2 (Protein Arginine Methyltransferase 2) is a Protein Coding gene. Diseases associated with PRMT2 include Breast Cancer. Among its related pathways are Retinoblastoma (RB) in Cancer and mRNA Splicing - Major Pathway. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include protein homodimerization activity and transcription coactivator activity. An important paralog of this gene is PRMT3.
Protein arginine methyltransferases are enyzmes that catalyze the transfer of methyl groups from S-adenosylmethionine (SAM) to the arginine residues on histones and other proteins. The dysregulation of this methylation is critical in the development of certain cancers.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0003713 | transcription coactivator activity | IDA | 12039952 |
GO:0005515 | protein binding | IPI | 11513728 |
GO:0008168 | methyltransferase activity | IEA | -- |
GO:0008469 | histone-arginine N-methyltransferase activity | ISS | -- |
GO:0016274 | protein-arginine N-methyltransferase activity | ISS | -- |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0005634 | nucleus | TAS,IDA | 11513728 |
GO:0005654 | nucleoplasm | IDA | -- |
GO:0005730 | nucleolus | IEA | -- |
GO:0005737 | cytoplasm | IEA,IDA | 11513728 |
GO:0005829 | cytosol | IDA | 17587566 |
SuperPathway | Contained pathways | ||
---|---|---|---|
1 | mRNA Splicing - Major Pathway |
.41
|
|
2 | Retinoblastoma (RB) in Cancer |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0006479 | protein methylation | IEA,TAS | 9545638 |
GO:0007165 | signal transduction | TAS | 9545638 |
GO:0016571 | histone methylation | ISS | -- |
GO:0019919 | peptidyl-arginine methylation, to asymmetrical-dimethyl arginine | IEA | -- |
GO:0032088 | negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity | IDA | 16648481 |
Name | Status | Disease Links | Group | Role | Mechanism of Action | Clinical Trials |
---|---|---|---|---|---|---|
s-adenosylhomocysteine | Experimental | Pharma | 0 |
Name | Synonyms | Role | CAS Number | PubChem IDs | PubMed IDs | |
---|---|---|---|---|---|---|
s-adenosylmethionine |
|
485-80-3 |
|
ExUns: | 1a | · | 1b | · | 1c | · | 1d | · | 1e | · | 1f | · | 1g | · | 1h | ^ | 2a | · | 2b | ^ | 3a | · | 3b | ^ | 4a | · | 4b | · | 4c | ^ | 5a | · | 5b | · | 5c | · | 5d | ^ | 6a | · | 6b | ^ | 7a | · | 7b | ^ | 8a | · | 8b | · | 8c | · |
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SP1: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP15: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP16: | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP18: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP19: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP20: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP21: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP22: | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP23: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP24: |
ExUns: | 8d | · | 8e | ^ | 9 | ^ | 10 | ^ | 11a | · | 11b | · | 11c | ^ | 12 | ^ | 13 | ^ | 14 | ^ | 15a | · | 15b | ^ | 16a | · | 16b | · | 16c | · | 16d |
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SP1: | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||
SP5: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||
SP8: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||
SP9: | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||
SP10: | |||||||||||||||||||||||||||||||
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SP16: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||
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SP18: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP19: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP20: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP21: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP22: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP23: | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||
SP24: |
This gene was present in the common ancestor of animals and fungi.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
---|---|---|---|---|---|
Chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | PRMT2 30 31 |
|
OneToOne | |
Cow (Bos Taurus) |
Mammalia | HRMT1L1 31 |
|
OneToOne | |
Dog (Canis familiaris) |
Mammalia | PRMT2 30 31 |
|
OneToOne | |
Mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Prmt2 30 17 31 |
|
OneToOne | |
Rat (Rattus norvegicus) |
Mammalia | Prmt2 30 |
|
||
Platypus (Ornithorhynchus anatinus) |
Mammalia | PRMT2 31 |
|
OneToOne | |
Oppossum (Monodelphis domestica) |
Mammalia | -- 31 |
|
ManyToMany | |
Tropical Clawed Frog (Silurana tropicalis) |
Amphibia | prmt2 30 |
|
||
Zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | prmt2 30 31 |
|
OneToOne | |
Fruit Fly (Drosophila melanogaster) |
Insecta | Art8 31 |
|
OneToOne | |
Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) |
Saccharomycetes | HMT1 31 |
|
OneToMany |
SNP ID | Clinical significance and condition | Chr 21 pos | Variation | AA Info | Type |
---|---|---|---|---|---|
710386 | Benign: not provided | 46,644,495(+) | C/T | INTRON_VARIANT | |
718694 | Benign: not provided | 46,661,896(+) | G/A | MISSENSE_VARIANT,INTRON_VARIANT | |
743660 | Likely Benign: not provided | 46,660,825(+) | T/C | THREE_PRIME_UTR_VARIANT,INTRON_VARIANT | |
748626 | Likely Benign: not provided | 46,649,679(+) | T/C | SYNONYMOUS_VARIANT | |
764005 | Likely Benign: not provided | 46,661,935(+) | C/A | MISSENSE_VARIANT,INTRON_VARIANT |
Variant ID | Type | Subtype | PubMed ID |
---|---|---|---|
dgv4441n100 | CNV | gain | 25217958 |
dgv4442n100 | CNV | gain | 25217958 |
dgv4443n100 | CNV | gain | 25217958 |
dgv4444n100 | CNV | gain | 25217958 |
dgv4446n100 | CNV | gain | 25217958 |
dgv4447n100 | CNV | loss | 25217958 |
dgv4448n100 | CNV | gain | 25217958 |
dgv4449n100 | CNV | gain+loss | 25217958 |
esv1540677 | CNV | insertion | 17803354 |
esv2658047 | CNV | deletion | 23128226 |
esv2758822 | CNV | gain | 17122850 |
esv34393 | CNV | gain | 17911159 |
esv3647171 | CNV | gain | 21293372 |
esv3647172 | CNV | loss | 21293372 |
esv3647173 | CNV | gain | 21293372 |
esv3647174 | CNV | loss | 21293372 |
nsv1059706 | CNV | gain | 25217958 |
nsv1078938 | CNV | insertion | 25765185 |
nsv1125229 | CNV | insertion | 24896259 |
nsv1129228 | CNV | insertion | 24896259 |
nsv1129684 | CNV | tandem duplication | 24896259 |
nsv470910 | CNV | gain | 18288195 |
nsv587999 | CNV | gain | 21841781 |
nsv588002 | CNV | gain | 21841781 |
nsv9864 | CNV | gain | 18304495 |
nsv9865 | CNV | gain | 18304495 |
Disorder | Aliases | PubMed IDs |
---|---|---|
breast cancer |
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