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NFRKB (Nuclear Factor Related To KappaB Binding Protein) is a Protein Coding gene. Diseases associated with NFRKB include Johanson-Blizzard Syndrome and Jacobsen Syndrome. Among its related pathways are Overview of nanoparticle effects and Deubiquitination. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include protease binding.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0002020 | protease binding | IPI | 18922472 |
GO:0003677 | DNA binding | IEA | -- |
GO:0005515 | protein binding | IPI | 18922472 |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0005634 | nucleus | IEA,IDA | 18922472 |
GO:0005654 | nucleoplasm | IDA,TAS | -- |
GO:0031011 | colocalizes_with Ino80 complex | IEA,IDA | 18922472 |
SuperPathway | Contained pathways | ||
---|---|---|---|
1 | Transcription-Coupled Nucleotide Excision Repair (TC-NER) | ||
2 | Metabolism of proteins | ||
3 | Deubiquitination |
.74
|
|
4 | DNA Double-Strand Break Repair |
.53
|
|
5 | CDK-mediated phosphorylation and removal of Cdc6 |
.47
|
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0006281 | DNA repair | IEA | -- |
GO:0006310 | DNA recombination | IEA | -- |
GO:0006974 | cellular response to DNA damage stimulus | IEA | -- |
GO:0016579 | protein deubiquitination | TAS | -- |
ExUns: | 1a | · | 1b | · | 1c | ^ | 2 | ^ | 3 | ^ | 4 | ^ | 5 | ^ | 6a | · | 6b | · | 6c | ^ | 7 | ^ | 8 | ^ | 9 | ^ | 10 | ^ | 11a | · | 11b | · | 11c | ^ | 12 | ^ | 13 | ^ | 14 | ^ | 15 | ^ | 16 | ^ | 17 | ^ | 18a | · | 18b | · | 18c | ^ |
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SP1: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: |
ExUns: | 19 | ^ | 20 | ^ | 21a | · | 21b | ^ | 22a | · | 22b | ^ | 23 | ^ | 24 | ^ | 25 | ^ | 26 |
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SP1: | - | ||||||||||||||||||
SP2: | |||||||||||||||||||
SP3: | |||||||||||||||||||
SP4: | |||||||||||||||||||
SP5: | |||||||||||||||||||
SP6: | |||||||||||||||||||
SP7: | |||||||||||||||||||
SP8: | |||||||||||||||||||
SP9: | |||||||||||||||||||
SP10: | |||||||||||||||||||
SP11: | |||||||||||||||||||
SP12: | |||||||||||||||||||
SP13: |
This gene was present in the common ancestor of animals.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
---|---|---|---|---|---|
Chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | NFRKB 30 31 |
|
OneToOne | |
Dog (Canis familiaris) |
Mammalia | NFRKB 30 31 |
|
OneToOne | |
Oppossum (Monodelphis domestica) |
Mammalia | NFRKB 31 |
|
OneToOne | |
Mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Nfrkb 30 17 31 |
|
OneToOne | |
Rat (Rattus norvegicus) |
Mammalia | Nfrkb 30 |
|
||
Platypus (Ornithorhynchus anatinus) |
Mammalia | NFRKB 31 |
|
OneToOne | |
Cow (Bos Taurus) |
Mammalia | NFRKB 30 31 |
|
OneToOne | |
Chicken (Gallus gallus) |
Aves | NFRKB 30 31 |
|
OneToOne | |
Lizard (Anolis carolinensis) |
Reptilia | NFRKB 31 |
|
OneToOne | |
Tropical Clawed Frog (Silurana tropicalis) |
Amphibia | nfrkb 30 |
|
||
MGC75871 30 |
|
||||
Zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | wu:fi86h10 30 |
|
||
NFRKB 31 |
|
OneToOne | |||
Fruit Fly (Drosophila melanogaster) |
Insecta | BcDNA:LD23876 32 |
|
|
|
CG11970 31 |
|
OneToOne | |||
Sea Squirt (Ciona savignyi) |
Ascidiacea | CSA.6838 31 |
|
OneToOne |
Variant ID | Type | Subtype | PubMed ID |
---|---|---|---|
esv2745255 | CNV | deletion | 23290073 |
esv3361985 | CNV | insertion | 20981092 |
Disorder | Aliases | PubMed IDs |
---|---|---|
johanson-blizzard syndrome |
|
|
jacobsen syndrome |
|
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