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This gene encodes a nuclear receptor co-repressor that mediates transcriptional silencing of certain target genes. The encoded protein is a member of a family of thyroid hormone- and retinoic acid receptor-associated co-repressors. This protein acts as part of a multisubunit complex which includes histone deacetylases to modify chromatin structure that prevents basal transcriptional activity of target genes. Aberrant expression of this gene is associated with certain cancers. Alternate splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms.[provided by RefSeq, Apr 2011]
NCOR2 (Nuclear Receptor Corepressor 2) is a Protein Coding gene. Diseases associated with NCOR2 include Acute Promyelocytic Leukemia and Lymphoma, Non-Hodgkin, Familial. Among its related pathways are Retinoic acid receptors-mediated signaling and Developmental Biology. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include sequence-specific DNA binding. An important paralog of this gene is NCOR1.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0000981 | DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific | ISA | -- |
GO:0001012 | RNA polymerase II regulatory region DNA binding | IBA | 21873635 |
GO:0003677 | DNA binding | IEA | -- |
GO:0003682 | chromatin binding | IBA | 21873635 |
GO:0003714 | transcription corepressor activity | IDA,IMP | 12628926 |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0000118 | histone deacetylase complex | IBA | 21873635 |
GO:0000785 | chromatin | IEA | -- |
GO:0000790 | nuclear chromatin | IDA | 20388878 |
GO:0005634 | nucleus | IDA,IEA | 12628926 |
GO:0005654 | nucleoplasm | IDA,TAS | -- |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0000122 | negative regulation of transcription by RNA polymerase II | TAS | -- |
GO:0007595 | lactation | IEA | -- |
GO:0010243 | response to organonitrogen compound | IEA | -- |
GO:0019216 | regulation of lipid metabolic process | TAS | -- |
GO:0032355 | response to estradiol | IEA | -- |
Name | Status | Disease Links | Group | Role | Mechanism of Action | Clinical Trials |
---|---|---|---|---|---|---|
Tretinoin | Approved, Investigational | Nutra | Full agonist, Agonist, Antagonist | 254 |
Name | Synonyms | Role | CAS Number | PubChem IDs | PubMed IDs |
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ExUns: | 1 | ^ | 2 | ^ | 3 | ^ | 4 | ^ | 5 | ^ | 6 | ^ | 7 | ^ | 8 | ^ | 9a | · | 9b | ^ | 10 | ^ | 11 | ^ | 12 | ^ | 13 | ^ | 14 | ^ | 15 | ^ | 16 | ^ | 17 | ^ | 18 | ^ | 19 | ^ | 20 | ^ | 21 | ^ | 22 | ^ | 23 | ^ | 24a | · | 24b | · |
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SP1: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ExUns: | 24c | ^ | 25 | ^ | 26 | ^ | 27a | · | 27b | · | 27c | ^ | 28a | · | 28b | · | 28c | ^ | 29a | · | 29b | ^ | 30 | ^ | 31 | ^ | 32 | ^ | 33a | · | 33b | · | 33c | · | 33d | ^ | 34a | · | 34b | · | 34c | ^ | 35 | ^ | 36a | · | 36b | ^ | 37 | ^ | 38a | · |
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SP1: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP5: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP26: |
ExUns: | 38b | ^ | 39 | ^ | 40a | · | 40b | · | 40c | · | 40d | ^ | 41a | · | 41b | · | 41c | · | 41d | ^ | 42a | · | 42b | · | 42c | · | 42d |
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SP1: | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||
SP2: | |||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||
SP5: | - | ||||||||||||||||||||||||||
SP6: | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||
SP7: | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||
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SP26: |
This gene was present in the common ancestor of animals and fungi.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
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chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | NCOR2 33 32 |
|
OneToOne | |
cow (Bos Taurus) |
Mammalia | NCOR2 33 32 |
|
OneToOne | |
dog (Canis familiaris) |
Mammalia | NCOR2 33 32 |
|
OneToOne | |
rat (Rattus norvegicus) |
Mammalia | Ncor2 32 |
|
||
mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Ncor2 17 33 32 |
|
||
platypus (Ornithorhynchus anatinus) |
Mammalia | NCOR2 33 |
|
OneToOne | |
oppossum (Monodelphis domestica) |
Mammalia | NCOR2 33 |
|
OneToOne | |
chicken (Gallus gallus) |
Aves | NCOR2 33 32 |
|
OneToOne | |
lizard (Anolis carolinensis) |
Reptilia | NCOR2 33 |
|
OneToOne | |
tropical clawed frog (Silurana tropicalis) |
Amphibia | ncor2 32 |
|
||
zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | ncor2 33 32 |
|
OneToOne | |
fruit fly (Drosophila melanogaster) |
Insecta | Smr 33 |
|
OneToOne | |
worm (Caenorhabditis elegans) |
Secernentea | gei-8 33 |
|
OneToOne | |
baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) |
Saccharomycetes | SNT1 33 |
|
OneToMany |
SNP ID | Clin | Chr 12 pos | Variation | AA Info | Type |
---|---|---|---|---|---|
rs774775666 | uncertain-significance, not provided | 124,340,628(-) | C/T | coding_sequence_variant, missense_variant | |
rs1000004914 | -- | 124,367,112(-) | A/C | intron_variant | |
rs1000007316 | -- | 124,396,787(-) | C/T | intron_variant | |
rs1000014917 | -- | 124,504,715(-) | C/T | intron_variant | |
rs1000023697 | -- | 124,473,080(-) | G/T | coding_sequence_variant, missense_variant |
Disorder | Aliases | PubMed IDs |
---|---|---|
acute promyelocytic leukemia |
|
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lymphoma, non-hodgkin, familial |
|
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leukemia, acute myeloid |
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