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This gene encodes a nuclear receptor co-repressor that mediates transcriptional silencing of certain target genes. The encoded protein is a member of a family of thyroid hormone- and retinoic acid receptor-associated co-repressors. This protein acts as part of a multisubunit complex which includes histone deacetylases to modify chromatin structure that prevents basal transcriptional activity of target genes. Aberrant expression of this gene is associated with certain cancers. Alternate splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms.[provided by RefSeq, Apr 2011]
NCOR2 (Nuclear Receptor Corepressor 2) is a Protein Coding gene. Diseases associated with NCOR2 include Acute Promyelocytic Leukemia and Dehydrated Hereditary Stomatocytosis 1 With Or Without Pseudohyperkalemia And/Or Perinatal Edema. Among its related pathways are Signaling by GPCR and Development NOTCH1-mediated pathway for NF-KB activity modulation. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include sequence-specific DNA binding. An important paralog of this gene is NCOR1.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0000977 | RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding | IBA | 21873635 |
GO:0001012 | RNA polymerase II regulatory region DNA binding | IEA | -- |
GO:0003677 | DNA binding | IEA | -- |
GO:0003682 | chromatin binding | IEA,IBA | 21873635 |
GO:0003714 | transcription corepressor activity | IDA,IMP | 12628926 |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0000118 | histone deacetylase complex | IBA | 21873635 |
GO:0000785 | chromatin | IEA | -- |
GO:0000790 | nuclear chromatin | IDA | 20388878 |
GO:0005634 | nucleus | IEA,IDA | 12628926 |
GO:0005654 | nucleoplasm | IDA,TAS | -- |
SuperPathway | Contained pathways | ||
---|---|---|---|
1 | Signaling by NOTCH1 | ||
2 | Notch Signaling Pathway (WikiPathways) | ||
3 | Transcriptional activity of SMAD2/SMAD3-SMAD4 heterotrimer | ||
4 | Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) | ||
5 | Development NOTCH1-mediated pathway for NF-KB activity modulation |
Development Notch Signaling Pathway
.55
Development NOTCH1-mediated pathway for NF-KB activity modulation
.55
|
Transcription Sin3 and NuRD in transcription regulation
.31
|
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0000122 | negative regulation of transcription by RNA polymerase II | TAS | -- |
GO:0007595 | lactation | IEA | -- |
GO:0010243 | response to organonitrogen compound | IEA | -- |
GO:0010565 | regulation of cellular ketone metabolic process | IMP | 19955185 |
GO:0019216 | regulation of lipid metabolic process | TAS | -- |
Name | Status | Disease Links | Group | Role | Mechanism of Action | Clinical Trials |
---|---|---|---|---|---|---|
Tretinoin | Approved, Investigational | Nutra | Agonist, Full agonist, Antagonist | 273 |
Name | Synonyms | Role | CAS Number | PubChem IDs | PubMed IDs |
---|
ExUns: | 1 | ^ | 2 | ^ | 3 | ^ | 4 | ^ | 5 | ^ | 6 | ^ | 7 | ^ | 8 | ^ | 9a | · | 9b | ^ | 10 | ^ | 11 | ^ | 12 | ^ | 13 | ^ | 14 | ^ | 15 | ^ | 16 | ^ | 17 | ^ | 18 | ^ | 19 | ^ | 20 | ^ | 21 | ^ | 22 | ^ | 23 | ^ | 24a | · | 24b | · |
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SP1: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP8: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP26: |
ExUns: | 24c | ^ | 25 | ^ | 26 | ^ | 27a | · | 27b | · | 27c | ^ | 28a | · | 28b | · | 28c | ^ | 29a | · | 29b | ^ | 30 | ^ | 31 | ^ | 32 | ^ | 33a | · | 33b | · | 33c | · | 33d | ^ | 34a | · | 34b | · | 34c | ^ | 35 | ^ | 36a | · | 36b | ^ | 37 | ^ | 38a | · |
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SP1: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP25: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP26: |
ExUns: | 38b | ^ | 39 | ^ | 40a | · | 40b | · | 40c | · | 40d | ^ | 41a | · | 41b | · | 41c | · | 41d | ^ | 42a | · | 42b | · | 42c | · | 42d |
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SP1: | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||
SP2: | |||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||
SP5: | - | ||||||||||||||||||||||||||
SP6: | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||
SP7: | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||
SP8: | |||||||||||||||||||||||||||
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SP13: | |||||||||||||||||||||||||||
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SP22: | - | ||||||||||||||||||||||||||
SP23: | |||||||||||||||||||||||||||
SP24: | |||||||||||||||||||||||||||
SP25: | |||||||||||||||||||||||||||
SP26: |
This gene was present in the common ancestor of animals and fungi.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
---|---|---|---|---|---|
Chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | NCOR2 30 31 |
|
OneToOne | |
Cow (Bos Taurus) |
Mammalia | NCOR2 30 31 |
|
OneToOne | |
Dog (Canis familiaris) |
Mammalia | NCOR2 30 31 |
|
OneToOne | |
Rat (Rattus norvegicus) |
Mammalia | Ncor2 30 |
|
||
Mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Ncor2 30 17 31 |
|
OneToOne | |
Oppossum (Monodelphis domestica) |
Mammalia | NCOR2 31 |
|
OneToOne | |
Platypus (Ornithorhynchus anatinus) |
Mammalia | NCOR2 31 |
|
OneToOne | |
Chicken (Gallus gallus) |
Aves | NCOR2 30 31 |
|
OneToOne | |
Lizard (Anolis carolinensis) |
Reptilia | NCOR2 31 |
|
OneToOne | |
Tropical Clawed Frog (Silurana tropicalis) |
Amphibia | ncor2 30 |
|
||
Zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | ncor2 30 31 |
|
OneToOne | |
Fruit Fly (Drosophila melanogaster) |
Insecta | Smr 31 |
|
OneToOne | |
Worm (Caenorhabditis elegans) |
Secernentea | gei-8 31 |
|
OneToOne | |
Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) |
Saccharomycetes | SNT1 31 |
|
OneToMany |
SNP ID | Clinical significance and condition | Chr 12 pos | Variation | AA Info | Type |
---|---|---|---|---|---|
800325 | Likely Pathogenic: Multiple myeloma | 124,336,959(-) | G/T | MISSENSE_VARIANT | |
rs774775666 | Uncertain Significance: not provided | 124,340,628(-) | C/T | MISSENSE_VARIANT | |
rs2229840 | - | p.Ala1699Thr | |||
rs2230944 | - | p.Pro2001Ser | |||
rs7978237 | - | p.Gly781Glu |
Disorder | Aliases | PubMed IDs |
---|---|---|
acute promyelocytic leukemia |
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dehydrated hereditary stomatocytosis 1 with or without pseudohyperkalemia and/or perinatal edema |
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clubfoot |
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prostate cancer |
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lung squamous cell carcinoma |
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