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The protein encoded by this gene is a member of a family of neural specific, zinc finger-containing DNA-binding proteins. The protein binds to the promoter regions of proteolipid proteins of the central nervous system and plays a role in the developing nervous system. [provided by RefSeq, Jul 2008]
MYT1 (Myelin Transcription Factor 1) is a Protein Coding gene. Diseases associated with MYT1 include Periventricular Leukomalacia. Among its related pathways are AKT Siganaling Pathway and MECP2 and Associated Rett Syndrome. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include DNA-binding transcription factor activity and enhancer sequence-specific DNA binding. An important paralog of this gene is MYT1L.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0000978 | RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding | IBA | 21873635 |
GO:0000981 | DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific | ISM | 19274049 |
GO:0003677 | DNA binding | IEA | -- |
GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | IEA,NAS | 1280325 |
GO:0008270 | zinc ion binding | IEA,NAS | 1280325 |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0000790 | nuclear chromatin | ISA | -- |
GO:0005634 | nucleus | IEA,NAS | 1280325 |
GO:0005654 | nucleoplasm | IDA | -- |
GO:0005829 | cytosol | IDA | -- |
SuperPathway | Contained pathways | ||
---|---|---|---|
1 | AKT Siganaling Pathway | ||
2 | MAPK Erk Pathway |
.32
|
|
3 | Cyclins and Cell Cycle Regulation |
Cyclins and Cell Cycle Regulation
.67
|
|
4 | Mitotic Roles of Polo Like Kinases |
Mitotic Roles of Polo Like Kinases
-
|
|
5 | Mitotic G1-G1/S phases |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0006355 | regulation of transcription, DNA-templated | IEA,NAS | 1280325 |
GO:0006357 | regulation of transcription by RNA polymerase II | IBA | 21873635 |
GO:0007275 | multicellular organism development | IEA | -- |
GO:0007399 | nervous system development | IEA | -- |
GO:0030154 | cell differentiation | IEA | -- |
ExUns: | 1 | ^ | 2 | ^ | 3 | ^ | 4 | ^ | 5 | ^ | 6 | ^ | 7 | ^ | 8 | ^ | 9 | ^ | 10 | ^ | 11 | ^ | 12 | ^ | 13 | ^ | 14 | ^ | 15 | ^ | 16 | ^ | 17 | ^ | 18a | · | 18b | ^ | 19 | ^ | 20 | ^ | 21 | ^ | 22a | · | 22b | · | 22c | · | 22d | · |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SP1: | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP14: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP15: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP16: |
ExUns: | 22e | ^ | 23 | ^ | 24 | ^ | 25a | · | 25b | ^ | 26a | · | 26b | · | 26c | ^ | 27 | ^ | 28a | · | 28b | ^ | 29 | ^ | 30a | · | 30b | · | 30c | · | 30d |
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SP1: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||
SP5: | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||
SP6: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||
SP7: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP14: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP15: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||
SP16: |
This gene was present in the common ancestor of eukaryotes.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
---|---|---|---|---|---|
Chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | MYT1 31 |
|
OneToOne | |
Dog (Canis familiaris) |
Mammalia | MYT1 30 31 |
|
OneToOne | |
Cow (Bos Taurus) |
Mammalia | MYT1 30 31 |
|
OneToOne | |
Rat (Rattus norvegicus) |
Mammalia | Myt1 30 |
|
||
Mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Myt1 30 17 31 |
|
OneToOne | |
Platypus (Ornithorhynchus anatinus) |
Mammalia | MYT1 31 |
|
OneToOne | |
Oppossum (Monodelphis domestica) |
Mammalia | MYT1 31 |
|
OneToOne | |
Chicken (Gallus gallus) |
Aves | MYT1 30 31 |
|
OneToOne | |
Lizard (Anolis carolinensis) |
Reptilia | MYT1 31 |
|
OneToOne | |
Tropical Clawed Frog (Silurana tropicalis) |
Amphibia | LOC100490628 30 |
|
||
African clawed frog (Xenopus laevis) |
Amphibia | LOC397982 30 |
|
||
Zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | myt1a 30 31 |
|
OneToMany | |
myt1b 31 |
|
OneToMany | |||
Fruit Fly (Drosophila melanogaster) |
Insecta | CG43689 31 |
|
OneToMany | |
Worm (Caenorhabditis elegans) |
Secernentea | ztf-11 31 |
|
OneToMany | |
Soybean (Glycine max) |
eudicotyledons | Gma.17722 30 |
|
||
Sea Squirt (Ciona savignyi) |
Ascidiacea | -- 31 |
|
OneToMany | |
Sea Vase (Ciona intestinalis) |
Ascidiacea | Cin.8435 30 |
|
SNP ID | Clinical significance and condition | Chr 20 pos | Variation | AA Info | Type |
---|---|---|---|---|---|
714389 | Likely Benign: not provided | 64,208,061(+) | G/A | MISSENSE_VARIANT | |
714902 | Benign: not provided | 64,227,888(+) | C/T | SYNONYMOUS_VARIANT | |
715432 | Benign: not provided | 64,232,248(+) | C/T | SYNONYMOUS_VARIANT | |
717277 | Likely Benign: not provided | 64,205,787(+) | C/T | SYNONYMOUS_VARIANT | |
717969 | Benign: not provided | 64,213,639(+) | G/T | SYNONYMOUS_VARIANT |
Disorder | Aliases | PubMed IDs |
---|---|---|
periventricular leukomalacia |
|