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KLHDC4 (Kelch Domain Containing 4) is a Protein Coding gene. Diseases associated with KLHDC4 include Huntington Disease-Like 2 and Noonan Syndrome 9. An important paralog of this gene is HCFC1.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0005515 | protein binding | IEA,IPI | 21044950 |
ExUns: | 1a | · | 1b | · | 1c | · | 1d | · | 1e | · | 1f | ^ | 2 | ^ | 3 | ^ | 4a | · | 4b | ^ | 5 | ^ | 6a | · | 6b | · | 6c | ^ | 7a | · | 7b | · | 7c | · | 7d | ^ | 8a | · | 8b | · | 8c | · | 8d | ^ | 9 | ^ | 10 | ^ | 11a | · | 11b | · |
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SP1: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP14: | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP15: | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP16: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP17: | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP18: | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP19: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP20: | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP21: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP22: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP23: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP24: |
ExUns: | 11c | · | 11d | · | 11e | ^ | 12 | ^ | 13a | · | 13b | · | 13c | · | 13d | ^ | 14 | ^ | 15 | ^ | 16a | · | 16b | · | 16c | ^ | 17a | · | 17b | ^ | 18 |
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SP1: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||
SP5: | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||
SP13: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP14: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP15: | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
SP16: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||
SP17: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP18: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP19: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP20: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP21: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP22: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP23: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP24: | - | - |
This gene was present in the common ancestor of eukaryotes.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
---|---|---|---|---|---|
Chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | KLHDC4 30 31 |
|
OneToOne | |
Cow (Bos Taurus) |
Mammalia | KLHDC4 30 31 |
|
OneToOne | |
Dog (Canis familiaris) |
Mammalia | KLHDC4 30 31 |
|
OneToOne | |
Mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Klhdc4 30 17 31 |
|
OneToOne | |
Oppossum (Monodelphis domestica) |
Mammalia | KLHDC4 31 |
|
OneToOne | |
Platypus (Ornithorhynchus anatinus) |
Mammalia | KLHDC4 31 |
|
OneToOne | |
Chicken (Gallus gallus) |
Aves | KLHDC4 30 31 |
|
OneToOne | |
Lizard (Anolis carolinensis) |
Reptilia | KLHDC4 31 |
|
OneToOne | |
Tropical Clawed Frog (Silurana tropicalis) |
Amphibia | klhdc4 30 |
|
||
LOC394683 30 |
|
||||
African clawed frog (Xenopus laevis) |
Amphibia | MGC53395 30 |
|
||
Zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | klhdc4 30 31 |
|
OneToOne | |
wufb95f04 30 |
|
||||
African malaria mosquito (Anopheles gambiae) |
Insecta | AgaP_AGAP005007 30 |
|
||
Fruit Fly (Drosophila melanogaster) |
Insecta | CG4069 30 31 |
|
OneToOne | |
Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) |
Saccharomycetes | KEL3 31 33 |
|
OneToOne | |
Thale Cress (Arabidopsis thaliana) |
eudicotyledons | AT5G50310 30 |
|
||
Rice (Oryza sativa) |
Liliopsida | Os04g0483600 30 |
|
SNP ID | Clinical significance and condition | Chr 16 pos | Variation | AA Info | Type |
---|---|---|---|---|---|
717235 | Benign: not provided | 87,696,571(-) | C/G | INTRON_VARIANT | |
735959 | Likely Benign: not provided | 87,696,624(-) | C/T | NON_CODING_TRANSCRIPT_VARIANT,SYNONYMOUS_VARIANT | |
rs2303771 | - | p.Thr102Ile | |||
rs2303772 | - | p.Leu56Val | |||
rs34779002 | - | p.Gly130Val |
Variant ID | Type | Subtype | PubMed ID |
---|---|---|---|
dgv3062n100 | CNV | loss | 25217958 |
dgv504n67 | CNV | gain | 20364138 |
esv1006084 | CNV | deletion | 20482838 |
esv1228666 | CNV | deletion | 17803354 |
esv1374631 | CNV | deletion | 17803354 |
esv1590350 | CNV | deletion | 17803354 |
esv2657033 | CNV | deletion | 23128226 |
esv2674128 | CNV | deletion | 23128226 |
esv2714934 | CNV | deletion | 23290073 |
esv2714935 | CNV | deletion | 23290073 |
esv2761934 | CNV | loss | 21179565 |
esv28345 | CNV | gain+loss | 19812545 |
esv3639524 | CNV | loss | 21293372 |
esv3639525 | CNV | loss | 21293372 |
esv3639526 | CNV | gain | 21293372 |
esv3639527 | CNV | loss | 21293372 |
esv3822 | CNV | loss | 18987735 |
esv3892934 | CNV | loss | 25118596 |
esv993111 | CNV | deletion | 20482838 |
nsv1061977 | CNV | loss | 25217958 |
nsv1062946 | CNV | gain | 25217958 |
nsv1126439 | CNV | deletion | 24896259 |
nsv1160441 | CNV | deletion | 26073780 |
nsv457616 | CNV | gain | 19166990 |
nsv471945 | CNV | novel sequence insertion | 20440878 |
nsv573535 | CNV | loss | 21841781 |
nsv573536 | CNV | gain | 21841781 |
nsv573537 | CNV | loss | 21841781 |
nsv573538 | CNV | loss | 21841781 |
nsv833322 | CNV | loss | 17160897 |
nsv952065 | CNV | deletion | 24416366 |
Disorder | Aliases | PubMed IDs |
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huntington disease-like 2 |
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noonan syndrome 9 |
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noonan syndrome 10 |
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