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FAM13A (Family With Sequence Similarity 13 Member A) is a Protein Coding gene. Diseases associated with FAM13A include Pulmonary Fibrosis, Idiopathic and Bronchitis. Among its related pathways are Signaling by GPCR and p75 NTR receptor-mediated signalling. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include GTPase activator activity. An important paralog of this gene is FAM13B.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0005096 | GTPase activator activity | IEA | -- |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0005829 | cytosol | TAS | -- |
SuperPathway | Contained pathways | ||
---|---|---|---|
1 | p75 NTR receptor-mediated signalling |
.36
|
|
2 | Signaling by GPCR | ||
3 | Signaling by Rho GTPases | ||
4 | Lung fibrosis |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0007165 | signal transduction | IEA | -- |
GO:0043547 | positive regulation of GTPase activity | IEA | -- |
GO:0051056 | regulation of small GTPase mediated signal transduction | TAS | -- |
ExUns: | 1a | · | 1b | · | 1c | · | 1d | ^ | 2 | ^ | 3 | ^ | 4a | · | 4b | ^ | 5a | · | 5b | ^ | 6a | · | 6b | ^ | 7 | ^ | 8a | · | 8b | · | 8c | · | 8d | · | 8e | ^ | 9a | · | 9b | · | 9c | · | 9d | ^ | 10a | · | 10b | · | 10c | ^ | 11a | · |
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SP1: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP14: |
ExUns: | 11b | ^ | 12a | · | 12b | · | 12c | ^ | 13 | ^ | 14a | · | 14b | ^ | 15a | · | 15b | ^ | 16a | · | 16b | · | 16c | ^ | 17a | · | 17b | · | 17c | ^ | 18a | · | 18b |
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SP1: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP14: |
This gene was present in the common ancestor of animals.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
---|---|---|---|---|---|
Chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | FAM13A1 30 31 |
|
OneToOne | |
Dog (Canis familiaris) |
Mammalia | FAM13A 30 31 |
|
OneToOne | |
Cow (Bos Taurus) |
Mammalia | FAM13A 31 |
|
OneToMany | |
-- 31 |
|
OneToMany | |||
Mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Fam13a 31 |
|
OneToOne | |
Oppossum (Monodelphis domestica) |
Mammalia | FAM13A 31 |
|
OneToOne | |
Platypus (Ornithorhynchus anatinus) |
Mammalia | -- 31 |
|
ManyToMany | |
Chicken (Gallus gallus) |
Aves | FAM13A 30 31 |
|
OneToOne | |
Lizard (Anolis carolinensis) |
Reptilia | FAM13A 31 |
|
OneToOne | |
Tropical Clawed Frog (Silurana tropicalis) |
Amphibia | fam13a 30 |
|
||
Zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | fam13a 30 31 |
|
OneToOne | |
Fruit Fly (Drosophila melanogaster) |
Insecta | CG6424 31 |
|
OneToMany | |
Sea Squirt (Ciona savignyi) |
Ascidiacea | -- 31 |
|
OneToMany |
SNP ID | Clinical significance and condition | Chr 04 pos | Variation | AA Info | Type |
---|---|---|---|---|---|
714040 | Likely Benign: not provided | 88,747,647(-) | C/T | MISSENSE_VARIANT | |
719801 | Benign: not provided | 88,732,091(-) | G/A | SYNONYMOUS_VARIANT | |
724953 | Likely Benign: not provided | 89,029,515(-) | G/A | SYNONYMOUS_VARIANT | |
775218 | Likely Benign: not provided | 88,851,190(-) | G/A | INTRON_VARIANT | |
778157 | Benign: not provided | 88,731,430(-) | T/TA | INTRON_VARIANT |
Disorder | Aliases | PubMed IDs |
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pulmonary fibrosis, idiopathic |
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bronchitis |
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pulmonary disease, chronic obstructive |
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