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FAM13A (Family With Sequence Similarity 13 Member A) is a Protein Coding gene. Diseases associated with FAM13A include Pulmonary Fibrosis, Idiopathic and Bronchitis. Among its related pathways are Signaling by GPCR and Lung fibrosis. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include GTPase activator activity. An important paralog of this gene is FAM13B.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0005096 | GTPase activator activity | IEA | -- |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0005829 | cytosol | TAS | -- |
SuperPathway | Contained pathways | ||
---|---|---|---|
1 | p75 NTR receptor-mediated signalling |
.36
|
|
2 | Signaling by GPCR | ||
3 | Signaling by Rho GTPases | ||
4 | Lung fibrosis |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0007165 | signal transduction | IEA | -- |
GO:0043547 | positive regulation of GTPase activity | IEA | -- |
GO:0051056 | regulation of small GTPase mediated signal transduction | TAS | -- |
ExUns: | 1a | · | 1b | · | 1c | · | 1d | ^ | 2 | ^ | 3 | ^ | 4a | · | 4b | ^ | 5a | · | 5b | ^ | 6a | · | 6b | ^ | 7 | ^ | 8a | · | 8b | · | 8c | · | 8d | · | 8e | ^ | 9a | · | 9b | · | 9c | · | 9d | ^ | 10a | · | 10b | · | 10c | ^ | 11a | · |
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SP1: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP14: |
ExUns: | 11b | ^ | 12a | · | 12b | · | 12c | ^ | 13 | ^ | 14a | · | 14b | ^ | 15a | · | 15b | ^ | 16a | · | 16b | · | 16c | ^ | 17a | · | 17b | · | 17c | ^ | 18a | · | 18b |
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SP1: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SP14: |
This gene was present in the common ancestor of animals.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
---|---|---|---|---|---|
Chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | FAM13A1 30 31 |
|
OneToOne | |
Dog (Canis familiaris) |
Mammalia | FAM13A 30 31 |
|
OneToOne | |
Cow (Bos Taurus) |
Mammalia | FAM13A 31 |
|
OneToMany | |
-- 31 |
|
OneToMany | |||
Mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Fam13a 31 |
|
OneToOne | |
Oppossum (Monodelphis domestica) |
Mammalia | FAM13A 31 |
|
OneToOne | |
Platypus (Ornithorhynchus anatinus) |
Mammalia | -- 31 |
|
ManyToMany | |
Chicken (Gallus gallus) |
Aves | FAM13A 30 31 |
|
OneToOne | |
Lizard (Anolis carolinensis) |
Reptilia | FAM13A 31 |
|
OneToOne | |
Tropical Clawed Frog (Silurana tropicalis) |
Amphibia | fam13a 30 |
|
||
Zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | fam13a 30 31 |
|
OneToOne | |
Fruit Fly (Drosophila melanogaster) |
Insecta | CG6424 31 |
|
OneToMany | |
Sea Squirt (Ciona savignyi) |
Ascidiacea | -- 31 |
|
OneToMany |
SNP ID | Clinical significance and condition | Chr 04 pos | Variation | AA Info | Type |
---|---|---|---|---|---|
rs147595342 | Benign: not provided | 88,731,430(-) |
T/TA NM_014883.4(FAM13A):c.2844-4dup |
INTRON | |
rs201019743 | Likely Benign: not provided | 88,851,190(-) |
G/A NM_014883.4(FAM13A):c.844-7C>T |
INTRON | |
rs60527761 | Benign: not provided | 89,020,506(-) |
A/G NM_014883.4(FAM13A):c.381T>C (p.Ser127=) |
SYNONYMOUS | |
rs74387785 | Likely Benign: not provided | 88,747,647(-) |
C/T NM_014883.4(FAM13A):c.2366G>A (p.Arg789His) |
MISSENSE | |
rs767389467 | Likely Benign: not provided | 89,029,515(-) |
G/A NM_014883.4(FAM13A):c.162C>T (p.Thr54=) |
SYNONYMOUS |
Disorder | Aliases | PubMed IDs |
---|---|---|
pulmonary fibrosis, idiopathic |
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|
bronchitis |
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pulmonary disease, chronic obstructive |
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