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This gene encodes a subunit of several, distinct complexes involved in the repression or activation of transcription. The encoded protein can independently repress transcription and is targeted to replication foci throughout S phase by interacting directly with the N-terminus of DNA methyltransferase 1. During late S phase, histone deacetylase 2 is added to this complex, providing a means to deacetylate histones in transcriptionally inactive heterochromatin following replication. The encoded protein is also a component of the nucleosome acetyltransferase of H4 complex and interacts with the transcriptional corepressor tumor susceptibility gene 101 and the pro-apoptotic death-associated protein 6, among others. Alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]
DMAP1 (DNA Methyltransferase 1 Associated Protein 1) is a Protein Coding gene. Diseases associated with DMAP1 include Cerebellar Ataxia, Deafness, And Narcolepsy, Autosomal Dominant and Atrophy Of Testis. Among its related pathways are Chromatin organization and Chromatin Regulation / Acetylation. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include chromatin binding and RNA polymerase II repressing transcription factor binding.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0001103 | RNA polymerase II repressing transcription factor binding | IDA | 15367675 |
GO:0003714 | transcription corepressor activity | IEA,IBA | 21873635 |
GO:0005515 | protein binding | IPI | 15367675 |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0000812 | Swr1 complex | IBA | 21873635 |
GO:0005634 | nucleus | NAS | 10888872 |
GO:0005654 | nucleoplasm | TAS | -- |
GO:0005657 | replication fork | IEA | -- |
GO:0005737 | cytoplasm | IEA,IDA | 15367675 |
SuperPathway | Contained pathways | ||
---|---|---|---|
1 | Chromatin organization | ||
2 | Chromatin Regulation / Acetylation | ||
3 | DNA Damage |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0000122 | negative regulation of transcription by RNA polymerase II | IBA,IDA | 15367675 |
GO:0006281 | DNA repair | IEA | -- |
GO:0006306 | DNA methylation | TAS | 10888872 |
GO:0006325 | chromatin organization | IEA | -- |
GO:0006338 | chromatin remodeling | IEA | -- |
ExUns: | 1a | · | 1b | · | 1c | · | 1d | ^ | 2a | · | 2b | · | 2c | · | 2d | · | 2e | ^ | 3a | · | 3b | · | 3c | ^ | 4a | · | 4b | ^ | 5a | · | 5b | ^ | 6a | · | 6b | · | 6c | · | 6d | ^ | 7 | ^ | 8a | · | 8b | · | 8c | · | 8d | ^ | 9 | ^ |
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SP1: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP15: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP19: | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP20: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP21: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP22: | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP23: |
ExUns: | 10a | · | 10b | · | 10c | ^ | 11a | · | 11b | · | 11c | · | 11d | ^ | 12a | · | 12b | ^ | 13 | ^ | 14 | ^ | 15 | ^ | 16 |
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SP1: | |||||||||||||||||||||||||
SP2: | |||||||||||||||||||||||||
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SP19: | |||||||||||||||||||||||||
SP20: | |||||||||||||||||||||||||
SP21: | |||||||||||||||||||||||||
SP22: | |||||||||||||||||||||||||
SP23: |
This gene was present in the common ancestor of eukaryotes.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
---|---|---|---|---|---|
Chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | DMAP1 30 31 |
|
OneToOne | |
Platypus (Ornithorhynchus anatinus) |
Mammalia | DMAP1 31 |
|
OneToOne | |
Cow (Bos Taurus) |
Mammalia | DMAP1 30 31 |
|
OneToMany | |
-- 31 |
|
OneToMany | |||
Dog (Canis familiaris) |
Mammalia | DMAP1 30 31 |
|
OneToOne | |
Mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Dmap1 30 17 31 |
|
OneToOne | |
Rat (Rattus norvegicus) |
Mammalia | Dmap1 30 |
|
||
Oppossum (Monodelphis domestica) |
Mammalia | DMAP1 31 |
|
OneToOne | |
Chicken (Gallus gallus) |
Aves | DMAP1 30 31 |
|
OneToOne | |
Lizard (Anolis carolinensis) |
Reptilia | DMAP1 31 |
|
OneToOne | |
Tropical Clawed Frog (Silurana tropicalis) |
Amphibia | dmap1 30 |
|
||
Str.296 30 |
|
||||
African clawed frog (Xenopus laevis) |
Amphibia | Xl.3244 30 |
|
||
Zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | dmap1 30 31 |
|
OneToOne | |
zgc55593 30 |
|
||||
African malaria mosquito (Anopheles gambiae) |
Insecta | AgaP_AGAP007387 30 |
|
||
Fruit Fly (Drosophila melanogaster) |
Insecta | DMAP1 30 31 |
|
OneToOne | |
CG11132 32 |
|
|
|||
Worm (Caenorhabditis elegans) |
Secernentea | ekl-4 30 31 |
|
OneToOne | |
Y105E8A.17 32 |
|
|
|||
Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) |
Saccharomycetes | SWC4 31 33 33 33 |
|
OneToOne | |
Thale Cress (Arabidopsis thaliana) |
eudicotyledons | AT2G47210 30 |
|
||
Rice (Oryza sativa) |
Liliopsida | Os05g0540800 30 |
|
||
Sea Squirt (Ciona savignyi) |
Ascidiacea | -- 31 |
|
OneToOne | |
Sea Vase (Ciona intestinalis) |
Ascidiacea | Cin.1946 30 |
|
SNP ID | Clinical significance and condition | Chr 01 pos | Variation | AA Info | Type |
---|---|---|---|---|---|
806129 | Uncertain Significance: not provided | 44,219,183(+) | G/A | MISSENSE_VARIANT |
Disorder | Aliases | PubMed IDs |
---|---|---|
cerebellar ataxia, deafness, and narcolepsy, autosomal dominant |
|
|
atrophy of testis |
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|
retinitis pigmentosa 58 |
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|
inflammatory bowel disease 1 |
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neuropathy, hereditary sensory, type ie |
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