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This gene encodes a component of the COP9 signalosome, an evolutionarily conserved multi-subunit protease that regulates the activity of the ubiquitin conjugation pathway. Alternatively spliced transcript variants that encode the same protein have been described. [provided by RefSeq, Mar 2014]
COPS7A (COP9 Signalosome Subunit 7A) is a Protein Coding gene. Diseases associated with COPS7A include Snail Allergy and Shrimp Allergy. Among its related pathways are Clathrin-mediated endocytosis and Transcription-Coupled Nucleotide Excision Repair (TC-NER). An important paralog of this gene is COPS7B.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0005515 | protein binding | IPI | 20399188 |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0005634 | nucleus | IEA | -- |
GO:0005654 | nucleoplasm | IDA,TAS | -- |
GO:0005737 | cytoplasm | IEA | -- |
GO:0005829 | cytosol | IDA,TAS | -- |
GO:0008180 | COP9 signalosome | IEA,IDA | 18850735 |
SuperPathway | Contained pathways | ||
---|---|---|---|
1 | Transcription-Coupled Nucleotide Excision Repair (TC-NER) | ||
2 | Clathrin-mediated endocytosis | ||
3 | Vesicle-mediated transport | ||
4 | DNA Double-Strand Break Repair |
.53
|
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0000338 | protein deneddylation | IDA | 19141280 |
GO:0000715 | nucleotide-excision repair, DNA damage recognition | TAS | -- |
GO:0006283 | transcription-coupled nucleotide-excision repair | TAS | -- |
GO:0010387 | COP9 signalosome assembly | IEA | -- |
GO:0016032 | viral process | IEA | -- |
ExUns: | 1a | · | 1b | · | 1c | · | 1d | ^ | 2a | · | 2b | ^ | 3a | · | 3b | ^ | 4a | · | 4b | ^ | 5a | · | 5b | ^ | 6 | ^ | 7a | · | 7b | ^ | 8 | ^ | 9 | ^ | 10 | ^ | 11a | · | 11b | · | 11c | · | 11d | ^ | 12 | ^ | 13a | · | 13b | · | 13c | · |
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SP1: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP14: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP15: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP16: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP17: | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP18: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP19: |
ExUns: | 13d | · | 13e | ^ | 14a | · | 14b |
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SP1: | |||||||
SP2: | |||||||
SP3: | - | - | |||||
SP4: | |||||||
SP5: | |||||||
SP6: | |||||||
SP7: | |||||||
SP8: | |||||||
SP9: | |||||||
SP10: | |||||||
SP11: | |||||||
SP12: | |||||||
SP13: | |||||||
SP14: | |||||||
SP15: | |||||||
SP16: | |||||||
SP17: | |||||||
SP18: | |||||||
SP19: |
This gene was present in the common ancestor of animals.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
---|---|---|---|---|---|
Chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | COPS7A 30 31 |
|
OneToOne | |
Oppossum (Monodelphis domestica) |
Mammalia | COPS7A 31 |
|
OneToOne | |
Dog (Canis familiaris) |
Mammalia | COPS7A 30 31 |
|
OneToOne | |
Rat (Rattus norvegicus) |
Mammalia | Cops7a 30 |
|
||
Mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Cops7a 30 17 31 |
|
OneToOne | |
Cow (Bos Taurus) |
Mammalia | COPS7A 30 31 |
|
OneToOne | |
Platypus (Ornithorhynchus anatinus) |
Mammalia | COPS7A 31 |
|
OneToOne | |
Chicken (Gallus gallus) |
Aves | COPS7A 30 31 |
|
OneToOne | |
Lizard (Anolis carolinensis) |
Reptilia | COPS7A 31 |
|
OneToOne | |
Zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | cops7a 30 31 |
|
OneToOne | |
Fruit Fly (Drosophila melanogaster) |
Insecta | CSN7b 32 |
|
|
|
CSN7 31 |
|
OneToMany | |||
Sea Squirt (Ciona savignyi) |
Ascidiacea | CSA.9499 31 |
|
OneToMany |
Disorder | Aliases | PubMed IDs |
---|---|---|
snail allergy |
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shrimp allergy |
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crustacean allergy |
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tomato allergy |
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melon allergy |
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