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The protein encoded by this gene may regulate the transport of mRNA. It may play a role in the differentiation of erythroblasts. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2016]
CAPRIN2 (Caprin Family Member 2) is a Protein Coding gene. Diseases associated with CAPRIN2 include Combined Oxidative Phosphorylation Deficiency 32 and Axenfeld-Rieger Syndrome, Type 1. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include RNA binding and signaling receptor binding. An important paralog of this gene is CAPRIN1.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0003723 | RNA binding | IEA | -- |
GO:0005102 | signaling receptor binding | IPI | 18762581 |
GO:0005515 | protein binding | IPI | 18762581 |
GO:0046872 | metal ion binding | IEA | -- |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0005654 | nucleoplasm | IDA | -- |
GO:0005737 | cytoplasm | IEA,IDA | 14593112 |
GO:0005739 | mitochondrion | IEA,IDA | 14593112 |
GO:0005813 | centrosome | IDA | -- |
GO:0005829 | cytosol | IDA | -- |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0017148 | negative regulation of translation | IEA | -- |
GO:0030154 | cell differentiation | IEA | -- |
GO:0030308 | negative regulation of cell growth | IDA | 14593112 |
GO:0032092 | positive regulation of protein binding | IDA | 18762581 |
GO:0033138 | positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation | IDA | 18762581 |
ExUns: | 1a | · | 1b | · | 1c | · | 1d | · | 1e | · | 1f | ^ | 2 | ^ | 3a | · | 3b | ^ | 4 | ^ | 5a | · | 5b | ^ | 6 | ^ | 7 | ^ | 8 | ^ | 9a | · | 9b | ^ | 10 | ^ | 11 | ^ | 12a | · | 12b | ^ | 13 | ^ | 14a | · | 14b | · | 14c | · | 14d | ^ |
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SP1: | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP14: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP15: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP16: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP17: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP18: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP19: | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP20: | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP21: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP22: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP23: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP24: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP25: | - | - | - |
ExUns: | 15a | · | 15b | · | 15c | ^ | 16 | ^ | 17 | ^ | 18a | · | 18b | ^ | 19a | · | 19b | ^ | 20a | · | 20b | · | 20c | · | 20d | ^ | 21 | ^ | 22a | · | 22b | ^ | 23 | ^ | 24 | ^ | 25 | ^ | 26a | · | 26b | · | 26c |
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SP1: | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP14: | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP15: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP16: | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP17: | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP18: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP19: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP20: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP21: | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP22: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP23: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP24: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP25: |
This gene was present in the common ancestor of animals.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
---|---|---|---|---|---|
Chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | CAPRIN2 30 31 |
|
OneToOne | |
Platypus (Ornithorhynchus anatinus) |
Mammalia | CAPRIN2 31 |
|
OneToOne | |
Dog (Canis familiaris) |
Mammalia | CAPRIN2 30 31 |
|
OneToOne | |
Cow (Bos Taurus) |
Mammalia | CAPRIN2 30 31 |
|
OneToOne | |
Mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Caprin2 30 17 31 |
|
OneToOne | |
Rat (Rattus norvegicus) |
Mammalia | Caprin2 30 |
|
||
Oppossum (Monodelphis domestica) |
Mammalia | CAPRIN2 31 |
|
OneToOne | |
Chicken (Gallus gallus) |
Aves | CAPRIN2 30 31 |
|
OneToOne | |
Lizard (Anolis carolinensis) |
Reptilia | CAPRIN2 31 |
|
OneToOne | |
Tropical Clawed Frog (Silurana tropicalis) |
Amphibia | caprin2 30 |
|
||
Str.17842 30 |
|
||||
African clawed frog (Xenopus laevis) |
Amphibia | Xl.3769 30 |
|
||
Zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | caprin2 30 31 |
|
OneToOne | |
wufj80b02 30 |
|
||||
Fruit Fly (Drosophila melanogaster) |
Insecta | Capr 31 |
|
OneToMany |
SNP ID | Clinical significance and condition | Chr 12 pos | Variation | AA Info | Type |
---|---|---|---|---|---|
779266 | Benign: not provided | 30,715,074(-) | C/T | SYNONYMOUS_VARIANT | |
785398 | Benign: not provided | 30,719,127(-) | A/G | SYNONYMOUS_VARIANT,INTRON_VARIANT | |
785399 | Benign: not provided | 30,731,402(-) | A/G | INITIATIOR_CODON_VARIANT,MISSENSE_VARIANT | |
786224 | Benign: not provided | 30,713,872(-) | A/G | SYNONYMOUS_VARIANT | |
788433 | Benign: not provided | 30,723,254(-) | G/A | INTRON_VARIANT |
Variant ID | Type | Subtype | PubMed ID |
---|---|---|---|
esv2745706 | CNV | deletion | 23290073 |
esv3629022 | CNV | loss | 21293372 |
nsv832361 | CNV | loss | 17160897 |
Disorder | Aliases | PubMed IDs |
---|---|---|
combined oxidative phosphorylation deficiency 32 |
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axenfeld-rieger syndrome, type 1 |
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cone-rod dystrophy 2 |
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