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BRD9 (Bromodomain Containing 9) is a Protein Coding gene. Diseases associated with BRD9 include Melkersson-Rosenthal Syndrome and Chronic Dacryoadenitis. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include nucleic acid binding and lysine-acetylated histone binding. An important paralog of this gene is BRD7.
Bromodomains (BRDs) are epigenetic reader domains that selectively recognize acetylated lysine residues on the tails of histone proteins, and are the only known protein modules that can target acetylated lysine residues.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0003676 | nucleic acid binding | NAS | 18559093 |
GO:0005515 | protein binding | IEA,IPI | 25416956 |
GO:0070577 | lysine-acetylated histone binding | IDA | 22464331 |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0005634 | nucleus | IBA | 21873635 |
GO:0016514 | SWI/SNF complex | IDA | 29374058 |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0006325 | chromatin organization | IEA | -- |
GO:0006357 | regulation of transcription by RNA polymerase II | IBA | 21873635 |
GO:0008150 | biological_process | ND | -- |
ExUns: | 1 | ^ | 2a | · | 2b | · | 2c | ^ | 3 | ^ | 4a | · | 4b | ^ | 5a | · | 5b | ^ | 6a | · | 6b | · | 6c | ^ | 7a | · | 7b | ^ | 8a | · | 8b | ^ | 9 | ^ | 10 | ^ | 11a | · | 11b | ^ | 12a | · | 12b | ^ | 13a | · | 13b | ^ | 14a | · | 14b | ^ |
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SP1: | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP19: | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP20: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP21: |
ExUns: | 15a | · | 15b | ^ | 16a | · | 16b | ^ | 17a | · | 17b | ^ | 18 | ^ | 19 | ^ | 20a | · | 20b | · | 20c | ^ | 21a | · | 21b | ^ | 22 | ^ | 23a | · | 23b | · | 23c | ^ | 24a | · | 24b | ^ | 25 |
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SP1: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP8: | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP16: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP19: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP20: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP21: |
This gene was present in the common ancestor of animals.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
---|---|---|---|---|---|
Chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | BRD9 30 31 |
|
OneToOne | |
Dog (Canis familiaris) |
Mammalia | BRD9 30 31 |
|
OneToOne | |
Oppossum (Monodelphis domestica) |
Mammalia | BRD9 31 |
|
OneToOne | |
Cow (Bos Taurus) |
Mammalia | BRD9 30 31 |
|
OneToOne | |
Rat (Rattus norvegicus) |
Mammalia | Brd9 30 |
|
||
Mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Brd9 30 17 31 |
|
OneToOne | |
Platypus (Ornithorhynchus anatinus) |
Mammalia | BRD9 31 |
|
OneToOne | |
Chicken (Gallus gallus) |
Aves | BRD9 30 31 |
|
OneToOne | |
Lizard (Anolis carolinensis) |
Reptilia | BRD9 31 |
|
OneToOne | |
Tropical Clawed Frog (Silurana tropicalis) |
Amphibia | brd9 30 |
|
||
Zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | brd9 30 31 |
|
OneToOne | |
zgc55797 30 |
|
||||
Fruit Fly (Drosophila melanogaster) |
Insecta | CG7154 31 |
|
OneToMany | |
Worm (Caenorhabditis elegans) |
Secernentea | swsn-9 31 |
|
OneToMany | |
Sea Squirt (Ciona savignyi) |
Ascidiacea | -- 31 |
|
OneToMany |
SNP ID | Clinical significance and condition | Chr 05 pos | Variation | AA Info | Type |
---|---|---|---|---|---|
708816 | Benign: not provided | 886,609(-) | C/T | NON_CODING_TRANSCRIPT_VARIANT,SYNONYMOUS_VARIANT | |
728823 | Likely Benign: not provided | 876,218(-) | G/A | INTRON_VARIANT | |
785112 | Benign: not provided | 865,587(-) | T/C | INTRON_VARIANT | |
rs34292369 | -. - | p.Ala266Thrp.Ala170Thr | |||
rs414349 | - | p.Ala389Thr |
Disorder | Aliases | PubMed IDs |
---|---|---|
melkersson-rosenthal syndrome |
|
|
chronic dacryoadenitis |
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|
fissured tongue |
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|
rhabdoid cancer |
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nut midline carcinoma |
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