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ATG2A (Autophagy Related 2A) is a Protein Coding gene. Diseases associated with ATG2A include Auditory Agnosia. Among its related pathways are Pathways of neurodegeneration - multiple diseases and Autophagy Pathway. An important paralog of this gene is ATG2B.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0005515 | protein binding | IPI | 20562859 |
GO:0032266 | phosphatidylinositol-3-phosphate binding | IBA | 21873635 |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0000407 | phagophore assembly site | IBA | 21873635 |
GO:0005783 | endoplasmic reticulum | IEA | -- |
GO:0005789 | endoplasmic reticulum membrane | IEA | -- |
GO:0005811 | lipid droplet | IEA | -- |
GO:0016020 | membrane | IEA | -- |
SuperPathway | Contained pathways | ||
---|---|---|---|
1 | Pathways of neurodegeneration - multiple diseases | ||
2 | Autophagy - animal | ||
3 | Macroautophagy | ||
4 | Spinocerebellar ataxia | ||
5 | Autophagy Pathway |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0000045 | autophagosome assembly | IBA,IMP | 28561066 |
GO:0000422 | autophagy of mitochondrion | IBA | 21873635 |
GO:0006914 | autophagy | IEA | -- |
GO:0034727 | piecemeal microautophagy of the nucleus | IBA | 21873635 |
GO:0044805 | late nucleophagy | IBA | 21873635 |
ExUns: | 1a | · | 1b | · | 1c | ^ | 2 | ^ | 3a | · | 3b | ^ | 4 | ^ | 5 | ^ | 6 | ^ | 7 | ^ | 8 | ^ | 9 | ^ | 10a | · | 10b | ^ | 11a | · | 11b | ^ | 12 | ^ | 13 | ^ | 14a | · | 14b | ^ | 15a | · | 15b | · | 15c | ^ | 16 | ^ | 17 | ^ | 18 | ^ |
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SP1: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: |
ExUns: | 19 | ^ | 20 | ^ | 21a | · | 21b | ^ | 22a | · | 22b | ^ | 23a | · | 23b | ^ | 24a | · | 24b | · | 24c | ^ | 25 | ^ | 26 | ^ | 27 | ^ | 28 | ^ | 29 | ^ | 30 | ^ | 31 | ^ | 32 | ^ | 33 | ^ | 34 | ^ | 35 |
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SP1: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: |
This gene was present in the common ancestor of animals and fungi.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
---|---|---|---|---|---|
Chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | ATG2A 30 31 |
|
OneToOne | |
Dog (Canis familiaris) |
Mammalia | ATG2A 30 31 |
|
OneToOne | |
Cow (Bos Taurus) |
Mammalia | ATG2A 30 31 |
|
OneToOne | |
Mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Atg2a 30 17 31 |
|
OneToOne | |
Rat (Rattus norvegicus) |
Mammalia | Atg2a 30 |
|
||
Platypus (Ornithorhynchus anatinus) |
Mammalia | ATG2A 31 |
|
OneToOne | |
Lizard (Anolis carolinensis) |
Reptilia | ATG2A 31 |
|
OneToOne | |
Tropical Clawed Frog (Silurana tropicalis) |
Amphibia | atg2a 30 |
|
||
Zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | ATG2A 31 |
|
OneToOne | |
LOC101883461 30 |
|
||||
Fruit Fly (Drosophila melanogaster) |
Insecta | Atg2 31 |
|
OneToMany | |
Worm (Caenorhabditis elegans) |
Secernentea | atg-2 30 31 |
|
OneToMany | |
Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) |
Saccharomycetes | ATG2 31 |
|
OneToMany | |
Sea Squirt (Ciona savignyi) |
Ascidiacea | CSA.1201 31 |
|
OneToMany |
SNP ID | Clinical significance and condition | Chr 11 pos | Variation | AA Info | Type |
---|---|---|---|---|---|
929770 | Uncertain Significance: Premature ovarian failure | 64,909,834(-) |
G/T NM_015104.3(ATG2A):c.1954C>A (p.Leu652Met) |
MISSENSE | |
rs140012093 | Benign: not provided | 64,907,655(-) |
G/A NM_015104.3(ATG2A):c.2517C>T (p.Asn839=) |
SYNONYMOUS | |
rs148192310 | Benign: not provided | 64,895,397(-) |
C/T NM_015104.3(ATG2A):c.5473G>A (p.Val1825Ile) |
MISSENSE | |
rs61741398 | Benign: not provided | 64,907,602(-) |
G/A NM_015104.3(ATG2A):c.2570C>T (p.Ala857Val) |
MISSENSE | |
rs61746812 | Benign: not provided | 64,909,798(-) |
C/T NM_015104.3(ATG2A):c.1990G>A (p.Val664Met) |
MISSENSE |
Disorder | Aliases | PubMed IDs |
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auditory agnosia |
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