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The protein encoded by this gene is important in purine metabolism by converting AMP to IMP. The encoded protein, which acts as a homotetramer, is one of three AMP deaminases found in mammals. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Apr 2012]
AMPD2 (Adenosine Monophosphate Deaminase 2) is a Protein Coding gene. Diseases associated with AMPD2 include Pontocerebellar Hypoplasia, Type 9 and Spastic Paraplegia 63, Autosomal Recessive. Among its related pathways are Metabolism of nucleotides and ATP/ITP metabolism. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include deaminase activity and AMP deaminase activity. An important paralog of this gene is AMPD3.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0003876 | AMP deaminase activity | IGI,NAS | 8764830 |
GO:0005515 | protein binding | IPI | 21044950 |
GO:0016787 | hydrolase activity | IEA | -- |
GO:0019239 | deaminase activity | IEA | -- |
GO:0046872 | metal ion binding | IEA | -- |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0005829 | cytosol | TAS | -- |
SuperPathway | Contained pathways | ||
---|---|---|---|
1 | Metabolism of nucleotides |
.01
|
|
2 | Metabolism |
.40
|
|
3 | ATP/ITP metabolism |
ATP/ITP metabolism
-
|
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0006188 | IMP biosynthetic process | IGI | 23911318 |
GO:0009117 | nucleotide metabolic process | IEA | -- |
GO:0009168 | purine ribonucleoside monophosphate biosynthetic process | IEA | -- |
GO:0032264 | IMP salvage | IEA | -- |
GO:0043101 | purine-containing compound salvage | TAS | -- |
Name | Status | Disease Links | Group | Role | Mechanism of Action | Clinical Trials |
---|---|---|---|---|---|---|
Ammonia | Approved | Pharma | 0 | |||
Propranolol | Approved, Investigational | Pharma | Antagonist, Inhibitor, Inhibition | Beta blocker | 287 | |
Water | Approved | Pharma | 0 | |||
Adenosine monophosphate | Approved, Investigational | Nutra | 0 | |||
Inosinic acid | Experimental | Pharma | 0 |
Name | Synonyms | Role | CAS Number | PubChem IDs | PubMed IDs |
---|
ExUns: | 1a | · | 1b | ^ | 2 | ^ | 3a | · | 3b | ^ | 4 | ^ | 5a | · | 5b | ^ | 6a | · | 6b | ^ | 7a | · | 7b | ^ | 8a | · | 8b | · | 8c | ^ | 9 | ^ | 10a | · | 10b | · | 10c | ^ | 11a | · | 11b | · | 11c | · | 11d | · | 11e | · | 11f | · | 11g | ^ |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SP1: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP14: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP15: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP16: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP17: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP18: |
ExUns: | 12 | ^ | 13a | · | 13b | ^ | 14a | · | 14b | ^ | 15a | · | 15b | ^ | 16a | · | 16b | ^ | 17a | · | 17b | ^ | 18a | · | 18b | · | 18c | ^ | 19 | ^ | 20 | ^ | 21a | · | 21b | ^ | 22a | · | 22b | · | 22c |
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SP1: | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP6: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP7: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP8: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP14: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP15: | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP16: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP17: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP18: |
This gene was present in the common ancestor of eukaryotes.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
---|---|---|---|---|---|
Chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | AMPD2 30 31 |
|
OneToOne | |
Oppossum (Monodelphis domestica) |
Mammalia | AMPD2 31 |
|
OneToOne | |
Cow (Bos Taurus) |
Mammalia | AMPD2 30 31 |
|
OneToOne | |
Dog (Canis familiaris) |
Mammalia | AMPD2 30 31 |
|
OneToOne | |
Rat (Rattus norvegicus) |
Mammalia | Ampd2 30 |
|
||
Mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Ampd2 30 17 31 |
|
OneToOne | |
Platypus (Ornithorhynchus anatinus) |
Mammalia | -- 31 |
|
ManyToMany | |
Chicken (Gallus gallus) |
Aves | AMPD2 31 |
|
OneToOne | |
Lizard (Anolis carolinensis) |
Reptilia | AMPD2 31 |
|
OneToOne | |
Tropical Clawed Frog (Silurana tropicalis) |
Amphibia | ampd2 30 |
|
||
Zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | ampd2 31 |
|
OneToMany | |
AMPD2 (2 of 2) 31 |
|
OneToMany | |||
African malaria mosquito (Anopheles gambiae) |
Insecta | AgaP_AGAP000577 30 |
|
||
Fruit Fly (Drosophila melanogaster) |
Insecta | CG32626 30 31 |
|
OneToOne | |
Worm (Caenorhabditis elegans) |
Secernentea | C34F11.3 30 31 |
|
OneToOne | |
C34F11.3b 32 |
|
|
|||
C34F11.3a 32 |
|
|
|||
A. gosspyii yeast (Eremothecium gossypii) |
Saccharomycetes | AGOS_ABR204C 30 |
|
||
K. Lactis Yeast (Kluyveromyces lactis) |
Saccharomycetes | KLLA0D06171g 30 |
|
||
Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) |
Saccharomycetes | AMD1 30 31 33 |
|
OneToMany | |
Thale Cress (Arabidopsis thaliana) |
eudicotyledons | FAC1 30 |
|
||
Rice (Oryza sativa) |
Liliopsida | Os07g0693500 30 |
|
||
Os.8779 30 |
|
||||
Barley (Hordeum vulgare) |
Liliopsida | Hv.7455 30 |
|
||
Wheat (Triticum aestivum) |
Liliopsida | Ta.9076 30 |
|
||
Bread mold (Neurospora crassa) |
Ascomycetes | NCU02979 30 |
|
||
Sea Squirt (Ciona savignyi) |
Ascidiacea | CSA.2537 31 |
|
OneToOne | |
Fission Yeast (Schizosaccharomyces pombe) |
Schizosaccharomycetes | ada1 30 |
|
SNP ID | Clinical significance and condition | Chr 01 pos | Variation | AA Info | Type |
---|---|---|---|---|---|
638368 | Uncertain Significance: Pontocerebellar hypoplasia, type 9 | 109,627,262(+) | T/C | MISSENSE_VARIANT | |
649488 | Uncertain Significance: Spastic paraplegia 63, autosomal recessive; Pontocerebellar hypoplasia, type 9 | 109,621,101(+) | G/T | FIVE_PRIME_UTR_VARIANT,INTRON_VARIANT | |
655115 | Uncertain Significance: Spastic paraplegia 63, autosomal recessive; Pontocerebellar hypoplasia, type 9 | 109,625,389(+) | G/A | MISSENSE_VARIANT,FIVE_PRIME_UTR_VARIANT,INTRON_VARIANT | |
665782 | Uncertain Significance: Spastic paraplegia 63, autosomal recessive; Pontocerebellar hypoplasia, type 9 | 109,628,416(+) | T/C | MISSENSE_VARIANT | |
703122 | Benign: Spastic paraplegia 63, autosomal recessive; Pontocerebellar hypoplasia, type 9 | 109,629,124(+) | C/A | SYNONYMOUS_VARIANT |
Variant ID | Type | Subtype | PubMed ID |
---|---|---|---|
dgv253n100 | CNV | gain | 25217958 |
dgv254n100 | CNV | gain+loss | 25217958 |
dgv255n100 | CNV | gain | 25217958 |
nsv2299 | CNV | deletion | 18451855 |
nsv510951 | OTHER | complex | 20534489 |
Disorder | Aliases | PubMed IDs |
---|---|---|
pontocerebellar hypoplasia, type 9 |
|
|
spastic paraplegia 63, autosomal recessive |
|
|
pontocerebellar hypoplasia |
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paraplegia |
|
|
hereditary spastic paraplegia |
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