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This gene encodes a member of the ATP-binding cassette (ABC) transporter superfamily. ATP-binding cassette proteins transport various molecules across extra- and intracellular membranes. The protein encoded by this gene displays antiviral effect against flaviviruses. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2017]
ABCF3 (ATP Binding Cassette Subfamily F Member 3) is a Protein Coding gene. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include ATPase activity. An important paralog of this gene is ABCF1.
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0005515 | protein binding | IPI | 21516116 |
GO:0005524 | ATP binding | IBA | 21873635 |
GO:0016887 | ATPase activity | IEA | -- |
GO:0045296 | cadherin binding | HDA | 25468996 |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0016020 | membrane | HDA | 19946888 |
GO ID | Qualified GO term | Evidence | PubMed IDs |
---|---|---|---|
GO:0051607 | defense response to virus | IEA | -- |
ExUns: | 1a | · | 1b | · | 1c | · | 1d | ^ | 2a | · | 2b | · | 2c | ^ | 3a | · | 3b | ^ | 4a | · | 4b | · | 4c | · | 4d | ^ | 5 | ^ | 6a | · | 6b | · | 6c | · | 6d | ^ | 7a | · | 7b | ^ | 8 | ^ | 9 | ^ | 10 | ^ | 11 | ^ | 12 | ^ | 13 | ^ |
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SP1: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP6: | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP8: | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP16: | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP17: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SP18: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SP20: |
ExUns: | 14a | · | 14b | · | 14c | · | 14d | ^ | 15a | · | 15b | · | 15c | ^ | 16 | ^ | 17 | ^ | 18 | ^ | 19 | ^ | 20a | · | 20b | ^ | 21 | ^ | 22a | · | 22b |
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SP1: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||
SP2: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||
SP3: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||
SP4: | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||
SP5: | |||||||||||||||||||||||||||||||
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SP8: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP9: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP10: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP11: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP12: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP13: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP14: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP15: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP16: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP17: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP18: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP19: | |||||||||||||||||||||||||||||||
SP20: | - |
This gene was present in the common ancestor of eukaryotes.
Organism | Taxonomy | Gene | Similarity | Type | Details |
---|---|---|---|---|---|
chimpanzee (Pan troglodytes) |
Mammalia | ABCF3 33 32 |
|
OneToOne | |
oppossum (Monodelphis domestica) |
Mammalia | ABCF3 33 |
|
OneToOne | |
dog (Canis familiaris) |
Mammalia | ABCF3 33 32 |
|
OneToOne | |
cow (Bos Taurus) |
Mammalia | ABCF3 33 32 |
|
OneToOne | |
rat (Rattus norvegicus) |
Mammalia | Abcf3 32 |
|
||
mouse (Mus musculus) |
Mammalia | Abcf3 17 33 32 |
|
||
platypus (Ornithorhynchus anatinus) |
Mammalia | ABCF3 33 |
|
OneToOne | |
chicken (Gallus gallus) |
Aves | ABCF3 33 32 |
|
OneToOne | |
lizard (Anolis carolinensis) |
Reptilia | ABCF3 33 |
|
OneToOne | |
tropical clawed frog (Silurana tropicalis) |
Amphibia | LOC100145696 32 |
|
||
African clawed frog (Xenopus laevis) |
Amphibia | LOC398565 32 |
|
||
zebrafish (Danio rerio) |
Actinopterygii | ABCF3 33 |
|
OneToOne | |
LOC100331227 32 |
|
||||
African malaria mosquito (Anopheles gambiae) |
Insecta | AgaP_AGAP012005 32 |
|
||
fruit fly (Drosophila melanogaster) |
Insecta | CG9330 33 32 |
|
OneToOne | |
worm (Caenorhabditis elegans) |
Secernentea | abcf-3 33 32 |
|
OneToOne | |
A. gosspyii yeast (Ashbya gossypii) |
Saccharomycetes | AGOS_AEL032W 32 |
|
||
baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) |
Saccharomycetes | GCN20 35 33 32 |
|
||
K. lactis yeast (Kluyveromyces lactis) |
Saccharomycetes | KLLA0A10857g 32 |
|
||
thale cress (Arabidopsis thaliana) |
eudicotyledons | GCN3 32 |
|
||
soybean (Glycine max) |
eudicotyledons | Gma.4290 32 |
|
||
corn (Zea mays) |
Liliopsida | Zm.4768 32 |
|
||
rice (Oryza sativa) |
Liliopsida | Os.10758 32 |
|
||
sea squirt (Ciona savignyi) |
Ascidiacea | CSA.1523 33 |
|
OneToOne | |
Cin.11475 32 |
|
||||
bread mold (Neurospora crassa) |
Ascomycetes | NCU04051 32 |
|
||
fission yeast (Schizosaccharomyces pombe) |
Schizosaccharomycetes | SPBC29A3.09c 32 |
|
||
sea squirt (Ciona intestinalis) |
Ascidiacea | Cin.11475 32 |
|
SNP ID | Clin | Chr 03 pos | Variation | AA Info | Type |
---|---|---|---|---|---|
rs143852274 | uncertain-significance, Malignant tumor of prostate | 184,189,867(+) | C/T | coding_sequence_variant, missense_variant | |
rs1000284977 | -- | 184,184,665(+) | C/T | upstream_transcript_variant | |
rs1000401479 | -- | 184,184,938(+) | A/G | upstream_transcript_variant | |
rs1000628076 | -- | 184,190,250(+) | T/G | intron_variant | |
rs1000855803 | -- | 184,192,210(+) | A/G | intron_variant |
No disorders were found for ABCF3 Gene.